Ingénieur d'études (H/F) biologisite en traitement de données (Génomique des populations des éléments transposables chez le moustique tigre Aedes albopictus)

Job Description

Missions

Dans le cadre d’un projet ANR piloté par M. Boulesteix visant à déterminer la contribution des éléments transposables à l’adaptation du moustique tigre Aedes albopictus aux environnements tempérés, la personne recrutée sera en charge de l'analyse de données de génotypage d'insertions d'éléments transposables obtenues à partir de populations d'origines géographiques variées. Elle devra comparer les résultats issus de différentes méthodes de génotypage et réaliser des analyses de génomique des populations de type scan génomique de différenciation.

Activity

La personne recrutée sera en charge des activités suivantes :
◦ Contrôle qualité des données de génotypage issues de différents pipelines
◦ Comparaison des données de génotypage issus de différents pipelines
◦ Analyses de génomique des populations de type scan génomique (BayPass, OutFlank)
◦ Rédaction de rapports d'analyses

Your Profil

Skills

◦ Compétences en bioinformatique (R, Bash, utilisation d'un cluster...)
◦ Connaissances en génétique / génomique des populations
◦ Rigueur dans le suivi des analyses
◦ Clarté dans la transmission des résultats (rapports techniques et communication orale)
◦ Capacité à identifier les problèmes techniques ET à proposer des solutions le cas échéant
◦ Anglais niveau B1 (CECRL) minimum

Your Work Environment

La personne recrutée rejoindra l'équipe Génétique et Evolution des Interactions (GEI) au sein du laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (LBBE) à Lyon (https://lbbe-web.univ-lyon1.fr/fr). Le LBBE est un grand laboratoire (approx. 200 personnes) dédié à l'étude de l'écologie et de l'évolution et reconnu pour son expertise en bioinformatique. Il accueille en son sein le cluster de calcul du pôle régional de bioinformatique. Les membres de l'équipe GEI s'intéressent au thème du conflit et de la coopération entre les composantes multiples des organismes, des gènes aux bactéries symbiotiques, virus et éléments transposables.
Nos petits + :
• Un environnement de travail stimulant au contact de personnels de la recherche
• Un accompagnement professionnel avec des formations internes au laboratoire
• Une possibilité de télétravailler
• Un restaurant d'entreprise qui permet de déjeuner à un prix intéressant.
• Le remboursement partiel des titres de transport (75%)
+ forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an
• Un site accessible en transport en commun (Tram T1 + T4 + bus)
• 44 jours de congés / RTT par an
• Contrat de protection sociale complémentaire

Compensation and benefits

Compensation

à partir de 2521 € brut mensuel selon expérience

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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