Informations générales
Intitulé de l'offre : (H/F) Post-doctorant / Post-doctorante : en analyse de données de transcriptomique à haut débit
Référence : UMR5558-NATARB-085
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : VILLEURBANNE
Date de publication : jeudi 31 octobre 2024
Type de contrat : Chercheur en contrat CDD
Durée du contrat : 4 mois
Date d'embauche prévue : 1 février 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : à partir de 3021 € brut mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
Section(s) CN : 29 - Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés
Missions
Ce recrutement s’inscrit dans le contexte du projet ANR Longevity, qui vise à comprendre les mécanismes moléculaires sous-jacents aux différences de longévité entre mâles et femelles dans différentes espèces. Le projet consiste, entre autres, à tester l’hypothèse du chromosome Y toxique, hypothèse qui sera évaluée chez la drosophile.
Le/la postdoctorant(e) travaillera dans le domaine de la génomique et de la biologie évolutive en analysant des données de transcriptomique à haut débit obtenues au cours de ce projet.
Activités
• Développement de pipelines bioinformatiques pour l’analyse de données RNAseq et small RNA.
• Analyse différentielle de l’expression.
• Mise en place de mesures phénotypiques de longévité.
• Participation à des réunions scientifiques, tant nationales qu’internationales, ainsi qu’aux activités internes de l’équipe et du laboratoire.
Compétences
Bioinformatique : Utilisation des outils en ligne de commande pour la mise au point de pipelines bioinformatiques robustes et reproductibles. Cela concerne principalement les analyses de RNAseq et small RNA. Une bonne connaissance de Gene Ontology est également requise.
Biologie fonctionnelle : Le projet mobilise des concepts de biologie évolutive et de biologie moléculaire évolutive. Une expérience dans la réalisation d’expériences de biologie moléculaire est nécessaire (PCRq, RT-qPCR, extraction d’ADN, extraction d’ARN).
Statistique et modélisation : Le projet nécessite une maîtrise des outils statistiques nécessaires à l’analyse différentielle d’expression, tels que les packages DeSeq2 ou EdgeR.
Rédaction et synthèse : Le projet est potentiellement vaste et nécessitera de grandes capacités de synthèse et de rédaction, ainsi qu’une grande autonomie, tant dans la réflexion que dans la mise en œuvre des analyses.
Contexte de travail
Le post-doctorat se déroulera au Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (LBBE) (CNRS, Université Claude Bernard – Lyon 1, VetAgro Sup), au sein de l’équipe Génétique et Évolution des Interactions (GEI). Le LBBE regroupe une centaine de membres permanents, intéressés par des thématiques variées dans le domaine de l’évolution, de l’écologie et de la santé. Les grands axes de recherche de l’équipe GEI incluent l’évolution des interactions, la dynamique des génomes ainsi que les interactions entre éléments transposables et génome hôte.
La personne recrutée sera encadrée par Cristina Vieira du LBBE, au sein de l’équipe GEI.
Informations complémentaires
Nos petits + :
• Un environnement de travail stimulant au contact de personnels de la recherche
• Un accompagnement professionnel avec des formations internes au laboratoire
• Une possibilité de télétravailler
• Un restaurant d'entreprise qui permet de déjeuner à un prix intéressant.
• Le remboursement partiel des titres de transport (75%)
+ forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an
• Un site accessible en transport en commun (Tram T1 + T4 + bus)
• 44 jours de congés / RTT par an
• Participation financière au frais de mutuelle