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Post-doc génomique des populations (H/F)

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Informations générales

Référence : UMR5554-NICGAL-001
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : vendredi 1 novembre 2019
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 6 janvier 2020
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2600 et 3000 euros bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

L'agent sera en charge de l'analyse des données de séquences d'ADN haut-débit générées dans le contexte du projet ANR Pseudogamy. Il s'agira de caractériser l'évolution du génome de nématodes ayant récemment acquis un système de reproduction original dans lequel les pères ne produisent que des fils, et les mères une majorité de filles clonales.

Activités

- analyse bioinformatique de données haut-débit
- recherche d'orthologie
- phylogénie et datations moléculaires
- génomique des populations, patrons de diversité génétique
- analyse de données d'expression liées au sexe
- estimation du taux de recombinaison

Compétences

- bonne connaissance des concepts majeurs de l'évolution et de la phylogénie moléculaire
- expérience avec l'analyse de données de séquences
- autonomie en bioinformatique (programmation de scripts sous linux, calcul intensif)
- intérêt pour la génomique
- bon niveau d'organisation et goût pour le travail d'équipe

Contexte de travail

Le projet Pseudogamy est un projet collaboratif porté par Marie Delattre (ENS Lyon) et impliquant 3 laboratoires situés à Lyon, Rennes et Montpellier. L'agent recruté sera en interaction régulière avec les partenaires du projet, mais aussi avec les membres de l'équipe "Phylogénie et Evolution Moléculaire" de l'ISEM (environ 25 personnes dont 13 permanents). L'agent sera encadré par Nicolas Galtier (DR CNRS) avec l'aide de Jonathan Romiguier (CR CNRS).

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