Missions

- Assurer le développement et le maintien de la plateforme de modélisation biomod2 (sous R) pour la modélisation des distributions d'espèces.
- Implémenter de nouveaux modules et fonctions sous biomod2 (abondances, mise jours des modèles existants, et paramterisations).
- Participer aux tests et développements d'approches de fine-tuning de biomod2.
- Appliquer les développements sur de divers jeux de données sur plusieurs projets de modélisation d'aire de répartition d'espèces.

Activités

. Travail en équipe sur le développement et le maintien de la plateforme de modélisation biomod2 (sous R)
• Test de nouvelles approches à implémenter sous biomod2
• Amélioration des fichiers d'aides et tests des paramètres par défaut sur biomod2
• Appliquer les modèles sur divers jeux de données, tests de paramètres, etc...
• Analyses de sensibilité des différents paramètres internes aux algorithmes implémentés dans biomod2.
• Rédaction de rapport d'avancement

Compétences

Le/la candidat(e) devra :
• être expert en statistiques appliquées à l'écologie
• être expert sur R et son langage
• bonne connaissance des approches de machine learning
• bonne connaissance des approches de parallélisation sous R
• bonne connaissance d'Unix et des environnements clusters et grilles de calculs • avoir connaissance de l'écologie et de la modélisation des espèces
• maitriser l'Anglais (écrit et parlé)
• être motivé par un projet d'équipe multidisciplinaire alliant écologie et mathématique
• démontrer autonomie, rigueur, pensée critique, et capacité à s'intégrer au sein d'une équipe internationale

Contexte de travail

Le/la candidat(e) sélectionné(e) rejoindra l'équipe BIOM « Décrire, comprendre et prévoir la distribution spatio-temporelle et la dynamique de la biodiversité et des écosystèmes (BIOdiversity Monitoring) », dont les objectifs de recherche sont d'étudier comment les changements globaux influencent la biodiversité, le fonctionnement des écosystèmes et les contributions de la nature aux sociétés. L'équipe fournit un excellent environnement intellectuel et l'infrastructure requise pour le projet de recherche, avec plusieurs postdocs et doctorants travaillant sur des thématiques complémentaires. En outre, le projet de recherche entre dans le cadre plus large de projets internationaux qui visent à développer de nouveaux modèles de distribution d'espèces. Plus généralement, l'équipe BIOM est une deux équipes du Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA), une UMR CNRS - Univ. Grenoble Alpes - Univ. Savoie Mont Blanc. Le LECA focalise sur la compréhension et la modélisation de l'impact des changements globaux sur la biodiversité et du fonctionnement des écosystèmes.