Missions

La personne prendra part à un projet sur l'empreinte génomique, un phénomène épigénétique essentiel chez des mammifères. Spécifiquement, le projet explore la régulation et rôle de la réplication asynchrone au niveau des domaines chromosomiques contrôlés par l'empreinte. Il/elle utilisera des approches diverses pour étudier le timing de la réplication, au niveau du génome et locus-spécifiquement, dans des cellules souches embryonnaires et différentiées. La personne réalisera des analyses moléculaires, biochimiques et bio-informatiques et emploiera des techniques de génomique fonctionnelle pour explorer des séquences régulatrices clefs et des trans régulateurs.

Activités

-Culture et différentiation des cellules souches embryonnaires.
-Des analyses du timing de la réplication de l'ADN, de la méthylation de l'ADN et de l'expression génique, traitement des données, des approches bio-informatiques. Microscopie en fluorescence pour visualiser les chromatides.
-Etudes fonctionnelles en utilisant des diverses technologies de CRISPR.

Compétences

Le candidat ou la candidate doit avoir montré des compétences en réplication de l'ADN ou en analyse de la chromatine, et avoir d'expérience théorique et expérimentale dans les domaines de la génétique et de la biologie moléculaire avec des connaissances en transcription/chromatine et de génomique fonctionnelle. Il est souhaitable que la personne soit également familier avec des approches bio-informatiques.

Contexte de travail

L'Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM) est une unité mixte de recherche CNRS et Université de Montpellier, de 180 personnes réparties en 15 groupes de recherche, 9 services communs (dont 5 mutualisés avec d'autres unités en biologie santé du campus CNRS) et 9 plateformes technologiques et scientifiques, à la pointe de la technologie (http://biocampus.cnrs.fr), dans une atmosphère internationale. L'IGMM est un institut multidisciplinaire dont les travaux ont un impact international fondamental et appliqué en biologie moléculaire et cellulaire. L'équipe «Empreinte Génomique et Développement », dirigée par Robert Feil, s'intéresse aux mécanismes épigénétiques avec un intérêt particulier pour l'empreinte génomique et des lncRNAs, ainsi que pour la structuration de la chromatine dans des cellules vivantes. Plus d'information au lien suivant : http://www.igmm.cnrs.fr/

L'équipe d'accueil (R. Feil) cherche une personne motivée et dynamique, plusieurs années après la thèse, ayant de bonnes compétences en biologie moléculaire et/ou des études génomiques, et de préférence avec de l'expérience en bio-informatique.

Quelques publications récentes de l'équipe d'accueil:
-- Dupont, C, Chahar, D, Trullo, A, Gostan, T, Surcis, C, Grimaud, C, Fisher, D, Feil R, Llères D. (2023). Evidence for low nanocompaction of heterochromatin in living embryonic stem cells. EMBO J. e110286.
--Noordermeer, D., Feil, R. (2020). Differential chromatin organization and gene activity in genomic imprinting. Curr. Opin. Genet. Dev., 61, 17-24.
-- Llères, D, Moindrot, B, Pathak, R., Piras, V., Matelot, M., Pignard, B., Marchand, A., Poncelet, M., Perrin, A., Tellier, V., Feil, R., Noordermeer, D. (2019). CTCF modulates allele-specific sub-TAD structuration and imprinted gene activity at the Dlk1-Dio3 and Igf2-H19 domains. Genome Biol., 20, 272.
-- Sanli, I., Lalevée, S., Camissa, M., Perrin, A., Rage, F., Riccio, A., Llères, D., Bertrand, E., Feil, R. (2018). Meg3 long non-coding RNA expression controls imprinting by preventing transcriptional upregulation in cis. Cell reports, 23, 337-348.272.
-- Prats-Puig, A., Carreras-Badoso, G., Bassols, J., Cavelier, P., Magret, A., Sabench, C., de Zegher, F., Ibanez, L., Feil, R, Lopez-Bermejo, A (2017). The placental imprinted DLK1-DIO3 domain: a new link to pre- and postnatal growth in humans. Am. J. Obstet. & Gynecology, 217, e1-350.
-- Kota, S.K., Lleres, D., Bouschet, T., Hirasawa, R., Marchand, A., Begon-Pescia, C., Sanli, I, Arnaud, P., Journot, L., Girardot, M. and Feil, R. (2014). ICR non-coding RNA expression controls imprinting and DNA replication at the Dlk1-Dio3 domain. Developmental Cell, 31, 19-33.