Missions

À l'IGMM, notre groupe Réseaux intégratifs des ARNs dans le développement s'intéresse à l'étude de la fonction des facteurs de transcription (FT) dans le traitement de l'ARNm et sa contribution à l'identité cellulaire. Ici, le projet se concentre sur les interactions établies par la famille des FT Hox au niveau de l'ARN messager pour explorer de nouvelles questions biologiques. Ce projet financé par l'ANR (TRren-D) vise à dévoiler les interactions entre la protéine Hox Ultrabithorax et les ARNm au cours du développement musculaire d’embryons de Drosophile.
L'ingénieure ou l'ingénieur aura en charge un projet basé sur la capture, l’identification et la visualisation de complexes TF-ARN in vivo dans le muscle embryonnaire de Drosophile, de manière indépendante (50%).
La personne apportera un support sur la biologie moléculaire et biochimie de complexes protéine-ARN in vitro (30%).
Elle contribuera à l’établissement et maintenance de lignées de drosophiles (10%) et à la veille des protocoles et la gestion des stocks de l’équipe (10%).

Activités

Expériences in vivo chez la Drosophile
-Entretenir des lignées et croisements, embryon collections, purification de complexe protéine-ARN pour séquençage, fixation, immunomarquage et microscopie confocale
Expériences in vitro ou en cellules
-Appliquer des techniques de clonage, biochimie des protéines et ARNs (production, purification), détection de complexe protéine-ARN (SDS-PAGE, RT-qPCR, RNA-IP)
-Réaliser des analyses informatiques de données incluant les analyses statistiques

Responsabilités
-Choisir et adapter des technologies en fonction des objectifs discutés en amont
-Développer et rédiger des protocoles et des rapports structurés en anglais
-Traiter et analyser les données, mettre en forme les résultats pour leur présentation en anglais
-Transmettre ses connaissances et compétences dans son domaine d'étude
-Participer à la diffusion et à la valorisation des résultats sous forme de présentations et de publications en anglais
-Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité

Compétences

Savoirs / connaissances
-Connaissances de base en biochimie, biologie cellulaire et moléculaire
-Connaissance de base sur les méthodes de détection d'interactions protéine-protéine et des ARNs
-Capacité orale et écrite à communiquer en anglais (équivalent de niveau C1)
-Connaissance appréciée sur la génétique de la drosophile ou l'analyse de transcriptome

Savoir-faire
-Excellentes compétences en biologie moléculaire (clonage, PCR, production d'ADN, purification, western-blot)
-Excellentes compétences dans une (ou plusieurs) des catégories suivantes : méthodes de biochimie liées aux protéines ou à l'ARN ou génétique de la Drosophile
-Compétences de base en imagerie confocale
-Bonnes compétences informatiques (excel, word, powerpoint)
-Une expérience en culture cellulaire ou dans l'analyse de donnée transcriptomique sera appréciée mais pas indispensable

Savoir-être
-Capacité à travailler de manière indépendante sur les pipelines discutés
-Forte curiosité d'apprendre de nouvelles techniques et contribuer aux différents projets de l'équipe
-Fort sens de l'organisation
-Rigueur sur les activités de reporting, suivi des protocoles en anglais, planning expérimentaux
-Capacité à travailler en équipe, à contribuer à la vie du laboratoire (actions communes, tâches)
-Qualités générales : Communication, Rigueur, Esprit d'équipe, Autonomie, Enthousiasme

Savoir généraux, théoriques ou disciplinaires
-Connaissance ou intérêt pour la régulation transcriptionnelle
-Connaissance ou expérience sur la biologie des ARNs ou des protéines ou du modèle Drosophile
-Connaissance ou motivation pour participer aux analyses bioinformatiques est un plus

Contexte de travail

L'Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier est une unité mixte de recherche CNRS et Université de Montpellier, de 200 personnes réparties en 17 groupes de recherche, 9 services communs (dont 5 mutualisés avec d'autres unité du campus CNRS) et 9 plateformes technologiques et scientifiques. L'IGMM est un institut multidisciplinaire dont les travaux ont un impact international fondamental et appliqué en biologie moléculaire et cellulaire (www.igmm.cnrs.fr).
L'agent sera affecté dans l'équipe dirigée par Julie Carnesecchi, nouvellement ouverte à l'IGMM. L’ingénieure ou l'ingénieur travaillera sur un projet central du laboratoire financé par l’ANR (projet TRren-D), et sera formé et supervisé directement par Julie Carnesecchi. Le travail d'équipe est en contexte international (anglais) et interdisciplinaire (biologie moléculaire, structurale, transcriptomique, imagerie), avec l’opportunité de contribuer à l’exploration des interactions TF-ARN à diverse échelles (in vitro, en cellules, in vivo dans le muscle de l’embryon).
Le projet bénéficie de l'environnement scientifique privilégié du Biocampus, et de ces plateformes technologiques (protéomique, séquençage, imagerie, www.biocampus.cnrs.fr).

Contraintes et risques

Possibilité de venir certains week-ends et jours fériés pour l'entretien des échantillons vivants (1 à 2h max/week-end)