Informations générales
Intitulé de l'offre : CDD Chercheur - Informaticien/statisticien pour l’analyse de réarrangements génomiques d’Anopheles (H/F)
Référence : UMR5506-KRISWE-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : vendredi 13 septembre 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 décembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : A partir de 3965,50€ Brut selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : Sciences de l'information : fondements de l'informatique, calculs, algorithmes, représentations, exploitations
Missions
L'équipe MAB du LIRMM (https://www.lirmm.fr/~swenson) recherche un chercheur postdoctoral maîtrisant les calculs et les statistiques, pour travailler pendant un an sur un projet lié à la réorganisation du génome chez les anophèles (moustiques). Le projet comprend le développement d'algorithmes pour l'inférence des réarrangements ancestraux à un clade dans une phylogénie, ainsi que leur mise en œuvre. Le projet sera réalisé en étroite collaboration avec le laboratoire de Sharakhov à Virginia Tech.
Activités
Reconstruction des ordres des gènes dans les chromosomes à partir des annotations
- implémentation d’outils informatiques pour lier les réarrangements génomique avec le donne Hi-C
- développement de méthodes statistiques pour les réarrangements génomiques
Compétences
- connaissances des algorithmes et structures de données
- développement des nouvelles algorithmes et structures de données
- connaissances et applications des méthodes statistiques
- compétences en programmation
Contexte de travail
Le travail sera effectué au LIRMM, au sein de l'équipe MAB (méthodes et algorithmes pour la bioinformatique) sous la responsabilité de Krister Swenson (https://www.lirmm.fr/~swenson) .
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.