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Ingénieur de recherches (H/F) : Algorithmique et génomique

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

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Informations générales

Référence : UMR5506-ERIRIV-001
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : vendredi 17 juillet 2020
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 septembre 2020
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2462 et 2642 euros bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Dans le cadre d'un contrat financé par l'Institut Français de Bioinformatique, ce poste destiné à un ingénieur ayant des compétences élevées en algorithmique contient deux volets, outre la participation aux projets d'analyse de données génomiques de la plateforme ATGC,
- développement de solutions pour l'analyse de données séquençage haut débit (SHD), en particulier de séquences virales,
- conception d'algorithmes de compression et indexation de séquences.

Dans le premier volet, la personne poursuivra le développement d'un outil permettant d'analyser les séquences virales, en vue d'application sur les génomes du Covid-19.
Le second volet vise à aider le développement d'outils capables de gérer et analyser des volumes de séquences sans cesse croissants.

Activités

- conception et développement de programmes (langages : javascript, python, C++, Julia)
- développement d'interface de visualisation
- rédaction de rapports, articles, documentations
- communication et exposé
- interaction avec les collaborateurs
- support aux formations.

Compétences

- développement informatique (front end)
- algorithmique avancée (indexation)
- connaissances en génomique
- communication et interaction pluridisciplinaires
- anglais.

Contexte de travail

Au sein du LIRMM, et de sa plateforme de bioinformatique ATGC, qui est dirigée par des membres de l'équipe de bioinformatique :
horaires du LIRMM, éventuels déplacements en mission.

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