Missions

Finaliser le développement et la validation d'une nouvelle classification des variants de p53 basée sur leur activité transcriptionnelle in vitro, mise au point depuis 4 ans dans l'équipe et analyser les signatures transcriptomiques associées à différentes classes de variants dans les cancers

Activités

1) Analyse transcriptomique de données publiques ou générées au laboratoire pôur identifier des signature spécifiques dans les cancers (mutations somatiques) et dans les tissus et cellules normalse (mutations constitutives)
2) Analyse bioinfomatique du caractère néoantigénique des variants et de son impact sur la pénétrance du cancer (mutation germinale) et/ou sur le phénotype cellulaire et moléculaire (mutation somatique)
3) Préparer la publication et la dissémination des résultats
Le projet se déroulera à l'Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble). Le chercheur s'appuiera sur les compétences en génération d'échantillons et analyse de données du groupe dirigé par P. Hainaut, ainsi que sur les compétences de collaborateurs (plateformes nationales et équipes internationales).

Compétences

- Savoirs / connaissances Biologie cellulaire et moléculaire / Cancer / Syndrome de Li-Fraumeni / TP53 / Approches omics. Très bonne connaissance de la variabilité des mutants de p53
- Savoir-faire Préparation d'échantillons pour analyse omics / Programmation sous R / Analyse et visualisation de données biologiques et cliniques par des d'algortithmes validés/ Ecriture des publications
- Savoirs-être Travail d'équipe / Autonomie / Capacité d'analyse / Capacité de synthèse / Communication
- Compétences managériales néant

Contexte de travail

L'institut pour l'avancée des Biosciences (IAB) est une unité mixte de recherche dont les tutelles sont le CNRS (UMR 5309), l'INSERM (U1209) et l'Université Grenoble Alpes. L'IAB développe un ensemble de programmes de recherche fondamentale et translationnelle dans les domaines de l'épigénétique, de l'environnement, de la plasticité cellulaire, appliquées aux cancers, aux infections parasitaires et à l'infertilité. L'IAB comprend 19 équipes s'appuyant sur 5 plateaux techniques. Le chercheur travaillera au sein de l'équipe Épigénétique, Immunité, Métabolisme, Signalisation cellulaire et Cancer', dont la thématique centrale est l'implication des mutants de p53 dans la dérégulation de plusieurs mécanismes fondamentaux qui contribuent à la cancérogenèse.
Sites web Institut pour l'Avancée des Biosciences, Grenoble : https://iab.univ-grenoble-alpes.fr/node/188/departement-environnement-reproduction-infections-cancer/equipe-hainaut-epigenetique-immunite-metabolisme-signalisation-cellulaire-et-cancer

Contraintes et risques

- Risques liés aux produits chimiques, aux émissions,
- Risque lié aux agents biologiques,
- Risque animalier,
- Risque lié au travail sur écran