Postdoctorat (H/F) sur la dynamique adaptative du hêtre face au changement climatique

Description du Poste

Les Missions

Face au changement climatique, les espèces peuvent (i) persister dans leur population originelle via leur plasticité, acclimatation ou adaptation aux nouvelles conditions climatiques, et/ou (ii) suivre le déplacement des conditions climatiques via leur capacité de dispersion modulée par la connectivité de leur habitat (Thurman et al. 2020). L’efficacité de ces réponses varient également à l’intérieur de l’aire de distribution des espèces. Ainsi, nous attendons à ce que la stratégie de persistance soit favoriser à la marge chaude de l’aire de l’espèce, et que la stratégie de migration soit favorisée à la marge froide (Oliveira et al. 2026).

L’objectif du postdoc est de quantifier et comprendre la dynamique adaptative du hêtre face au changement climatique et comment celle-ci varie à l’intérieur de son aire de distribution dans les Pyrénées. Le/La postdoc analysera un jeu de données combinant les génomes complets de 288 individus et des mesures génétiques dérivées de celui-ci (SNP, diversité génétique, ...), la performance des individus (croissance, résistance au stress hydrique, …) et la description du milieu (microclimat, sol, peuplement forestier) réalisée sur 56 sites Pyrénéens le long de transects altitudinaux soumis à différents niveaux de stress hydrique et thermique. Les individus échantillonnés sur chaque site sont composés pour moitié d’arbres adultes et de régénération, soit des individus ayant répondu à des pressions de sélections potentiellement différentes (notamment en termes de climats). Cette originalité doit permettre d’analyser la dynamique éco-évolutive du hêtre dans les Pyrénées.

Au cours de son postdoc, le/la candidat(e) devra:
(1) déterminer comment la diversité génétique (Ho, Pi, theta) du hêtre varie en fonction des conditions hydriques, thermiques et de ses stades de développement. Il s’agira également d’évaluer les contributions relatives des processus évolutifs neutres (dérive) et adaptatifs (sélection) aux variations de diversité associés aux contraintes climatiques et à leurs évolutions;

(2) évaluer les variations de fréquences alléliques et les signatures de sélection des gènes candidats associés aux stress climatiques des végétaux à l’intérieur de l’aire de distribution du hêtre où la pression de sélection associée au climat varie. Cette analyse comparera les stades de développement afin de distinguer les effets passés (ayant impactés les arbres adultes) des effets récents (régénération) et de mettre en évidence une potentielle dynamique adaptative ;

(3a) identifier les régions génomiques dont la diversité est fortement associée aux gradients environnementaux (altitude, stress hydrique et thermique), et potentiellement sélectionnées par des conditions environnementales particulières. L’interprétation de ces résultats se basera sur le rôle fonctionnel des régions génomiques identifiées ;

(et/ou 3b) déterminer le niveau de mal-adaptation des populations de hêtre dans les Pyrénées aux conditions climatiques et leurs évolutions à partir d’analyse de genomic offset (e.g. Capblanc et al. 2020). Les modèles et métriques obtenus seront extrapolés à l’effet de scénario climatique futur pour identifier des zones de mal-adaptation potentielles du hêtre au cours du 21°s et donc menacées. Cette approche pourra également être utilisée pour informer un modèle de redistribution du hêtre basé sur les processus.

Références:
Capblancq, T., Fitzpatrick, M. C., Bay, R. A., Exposito-Alonso, M., & Keller, S. R. (2020). Genomic prediction of (mal) adaptation across current and future climatic landscapes. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics, 51(1), 245-269.

Oliveira, B. F., Bertrand, R., Comte, L., Lenoir, J., Grenouillet, G., Lancaster, L. T., ... & Rolland, J. (2026). Genetic Diversity Impacts Climate‐Induced Species Range Shifts. Ecology Letters, 29(4), e70345.

Thurman, L. L., Stein, B. A., Beever, E. A., Foden, W., Geange, S. R., Green, N., ... & Young, B. E. (2020). Persist in place or shift in space? Evaluating the adaptive capacity of species to climate change. Frontiers in Ecology and the Environment, 18(9), 520-528.

L'Activité

- analyse de données et modélisation
- gestion d'une base de données
- collecte de données sur le terrain et au laboratoire
- écriture d'articles et communication scientifiques
- animation de réunions et d'un projet collaboratif

Votre Profil

Compétences

- Être titulaire d’une thèse en écologie évolutive ;
- Le candidat doit avoir de solides connaissances en génomique, bioinformatique et analyse de données complexes et spatialisées (modèles linéaire ou non-linéaire à effets mixtes, …) ;
- Une maîtrise des concepts impliqués dans la réponse éco-évolutive des espèces aux changements environnementaux est souhaitée ;
- Une expérience antérieure sur l’étude de la réponse des forêts au changement climatique et/ou l’adaptation évolutive des plantes ;
- Une expérience et un attrait pour la collecte de données sur le terrain et la mesure de traits au laboratoire est un plus.

Votre Environnement de Travail

Le sujet de thèse proposé s'inscrit dans le cadre du projet FREEvol visant à étudier les mécanismes éco-évolutifs qui déterminent la réponse du fonctionnement de l'écosystème forestier face au changement climatique. Le candidat sera hébergé au Centre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement (CRBE) situé à Toulouse sur le campus de l'Université Toulouse 3 - Paul Sabatier.

Le travail sera encadré par Romain Bertrand (CRBE, CNRS Toulouse), et pourra interagir et collaborer avec d’autres chercheurs du CRBE (comme Jordi Salmona, Jonathan Rolland, ...) ou d’autres laboratoires (Thibault Capblancq, Joris Bertrand, ...) ainsi qu’avec la plateforme de bioinformatique de la GENOTOUL (en charge des analyses bioinformatiques associée aux données de séquençage, jusqu’à l’identification des variants (SNP, indels, etc.), et du support bioinformatique tout au long du postdoc).

Le postdoc commencera vraisemblablement par la collecte de données dans les Pyrénées (microclimat, carottage et mesure de la taille des arbres).
Les candidatures devront inclure :
- un CV détaillé (2 pages max) avec les coordonnées de deux références (personnes susceptibles d'être contactées),
- une lettre de motivation (1 page max) montrant l'adéquation du candidat avec le sujet proposé,
- 2 publications scientifiques et/ou manuscrit de thèse (lien accepté si la publication est disponible en openaccess, sinon les publications devront être fusionnées à la lettre de motivation).

La candidature et tous les documents demandés doivent être déposés sur le portail emploi.cnrs.fr.
La date limite des candidatures est le 5 juillet 2026. Une première sélection portera sur l’évaluation des documents envoyés, puis un entretien sera organisé devant un jury où le candidat nous présentera son expérience et en quoi celle-ci sera utile pour mener à bien le projet du postdoc.

Le postdoc démarrera le 1er septembre 2026 (1er octobre au plus tard) pour une durée de 12 à 16 mois (dépend de l’expérience du candidat) avec une possible extension de 2 à 3 mois.

Contraintes et risques

Possible collecte de données en moyenne montagne.

Rémunération et avantages

Rémunération

entre 3041€ 4395€ brut mensuel selon expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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