Ingénieur-e de recherche en biologie moléculaire et analyses d'ADNe - PEPR Dynabiod (H/F)

Job Description

Missions

Sous la responsabilité opérationnelle du pôle de biologie moléculaire du CRBE (b2M) et en lien étroit avec le Pôle Transverse de Génomique Environnementale du PEPR Dynabiod (PT1), l’ingénieur-e de recherche assurera le pilotage des activités expérimentales liées aux analyses d’ADN environnemental (ADNe).
La personne recrutée aura pour mission de :
– Développer et mettre en œuvre des méthodes moléculaires innovantes et à haut débit pour l'analyse de la biodiversité à partir d’ADNe.
– Aider à la conception, l’optimisation et au suivi des workflows de biologie moléculaire, au bénéfice du pôle b2M et de l'ensemble des plateformes du PT1.

Activity

1. Développement technologique
– Concevoir, optimiser et déployer des workflows expérimentaux à haut débit, rapides, robustes et répétables pour l’analyse de l’ADNe sur différentes matrices (sol, eau, air, mélanges de tissus).
– Intégrer une démarche rigoureuse de contrôle qualité à chaque étape des protocoles moléculaires.
– Conduire des projets de développement technologique pour réaliser des évaluations massives et fiables de la diversité biologique.
– Assurer une veille scientifique et technologique sur les évolutions en biologie moléculaire pour adapter en permanence les protocoles aux besoins du projet.
2. Pilotage opérationnel, coordination et suivi
– Coordonner et plannifier les activités expérimentales menées au sein du pôle b2M pour le projet Dynabiod.
– Mettre en place un outil/système de suivi opérationnel de l’avancement des analyses, des workflows et des livrables.
– Gérer les moyens techniques et financiers alloués au projet.
– Organiser les missions de terrain et participer à la mise en œuvre des techniques moléculaires et expérimentales directement sur site.
3. Animation, accueil et valorisation
– Échanger étroitement avec l’équipe du pôle b2M et participer activement aux réunions de travail hebdomadaires.
– Accueillir les équipes des sous-projets du PEPR Dynabiod et assurer la gestion logistique associée.
– Diffuser et valoriser les résultats ainsi que les réalisations technologiques sous forme de rapports, de publications et/ou de présentations orales.

Your Profil

Skills

Connaissances scientifiques et techniques
– Connaissances solides en écologie/évolution et/ou en applications de l'ADNe dans un cadre environnemental.
– Maîtrise approfondie des méthodes modernes de biologie moléculaire (amplification d'ADN, métabarcoding, séquençage haut débit / NGS, q/ddPCR).
– Connaissance théorique et pratique approfondie du fonctionnement des appareillages de biologie moléculaire.
– Maîtrise des principes de gestion et de contrôle de la qualité des données.
Savoir-faire
– Solide aptitude à la conduite de projets (planification, priorisation des tâches, suivi, reporting, animation de réunions).
– Capacité à structurer son activité et celle du projet Dynabiod en synergie avec le planning des autres membres du pôle b2M et des plateaux du PEPR.
– Bases en analyse bioinformatique (environnement Unix/Linux).
– Capacité à organiser, coordonner et conduire des missions de terrain pour la collecte de données.
– Maîtrise de l'anglais scientifique et technique (niveau B2 minimum à l'écrit et à l'oral).
Savoir-être
– Autonomie, esprit d’innovation, créativité, sens de l'initiative et force de proposition.
– Excellentes qualités relationnelles, diplomatie et goût prononcé pour le travail en équipe et les projets collectifs.
– Capacités d'écoute, de dialogue et de communication.

Your Work Environment

Le poste sera basé au Centre de Recherche sur la Biodiversité et l’Environnement (CRBE), situé sur le campus de l’Université de Toulouse. L'ingénieur-e sera intégré-e au plateau technique Biologie moléculaire et Microbiologie (b2M).
Le projet s'inscrit dans le cadre du PEPR Dynabiod, et plus particulièrement au sein du Programme Ciblé "Standards, procédures et protocoles pour l’inventaire et les suivis modernes de la biodiversité et des interactions passées et actuelles". Le PEPR Dynabiod, financé par l’Agence Nationale de la Recherche via le Plan d’Investissement d’Avenir France 2023, vise à approfondir la compréhension des dynamiques de la biodiversité terrestre -plantes et invertébrés- afin de mieux la préserver. Coporté par le CNRS et le MNHN, Dynabiod fédère une communauté scientifique pluridisciplinaire mobilisant des approches innovantes (génomique environnementale, télédétection, intelligence artificielle, sciences participatives...) pour caractériser et comprendre les variations temporelles de la biodiversité, passées ( grâce aux collections d’histoire naturelle), présentes (dispositifs de suivis) et futures (scénarios).

Compensation and benefits

Compensation

Entre 3143,64 € et 4 756,76 €

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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