Ingénieur de recherche en biologie moléculaire (H/F)

Description du Poste

Les Missions

La personne recrutée participera au développement et à la mise en place du séquençage en grands fragments (long-read) pour le diagnostic des maladies neurologiques héréditaires. Elle participera également à la gestion et la valorisation des données du laboratoire.

L'Activité

-Développement et mise en œuvre des outils diagnostiques pour le séquençage d’ADN en grands fragments (« long read ») dans le cadre du plan de médecine génomique du CHU: réalisation d’essais de validation de méthode sur le séquenceur du laboratoire, paramétrage bioinformatique adapté aux expansions de répétition, développement d'une interface ergonomique de traitement des résultats ;
-Transfert de ces techniques en routine et rédaction des dossiers de validation de méthode en vue de l’accréditation ISO 15189;
-Analyse des données du long read pour l’étude des modulateurs de phénotype en lien avec les équipes cliniques du Centre de Référence des maladies neuromusculaires du CHU;
-Gestion et valorisation des données du laboratoire : constitution d'une base de données informatisée de l'ensemble des données biologiques et moléculaires, déclaration de la collection biologique
-Développements fonctionnels et études des variants structuraux : études de grands réarrangements et de variants de promoteurs en partenariat avec la plateforme d’étude fonctionnelle du CBPE (Dr A. Janin, Dr Y. Jourdy) pour la résolution de cas inexpliqués ;
-Valorisation scientifique : participation à des congrès, workshops et collaborations inter-CHU

Votre Profil

Compétences

- Niveau Ingénieur hospitalier ou Ingénieur de recherche
- Avoir déjà manipulé des échantillons biologiques en laboratoire (pipeter, gestion des déchets, équipement de protection individuelle)
- Avoir une expérience solide en biologie moléculaire : maîtrise du NGS, expérience en séquençage type « long-read » souhaité
- Expérience en analyse fonctionnelle des variants moléculaires
- Connaissance des bases de données et des outils de prédiction d’analyse moléculaire
- Être à l’aise avec les outils informatiques pour l’exploitation des résultats : Excel, Word, logiciels de statistiques, python…
- Avoir déjà réalisé des synthèses de données/résultats
- Maîtrise de l’anglais scientifique souhaité (analyse bibliographique, échanges avec collaborateurs internationaux)
- Connaître les Bonnes Pratiques de Laboratoire et les critères d’accréditation des examens de laboratoire d’analyse médicale selon la norme EN-ISO 15189
- Capacité d’appropriation d’un projet, de planification des tests / essais et d’analyse critique des résultats
- Avoir une capacité d’autonomie et d’adaptabilité
- Une expérience d’encadrement serait un plus

Votre Environnement de Travail

Les missions de l’ingénieur seront réalisées au sein de l’unité de Neurogénétique des HCL, Centre de Biologie et Pathologie Est, Groupement Hospitalier Est à Bron sous la direction du Dr Isabelle QUADRIO. Le candidat rejoindra une équipe reconnue dans le domaine des maladies génétiques rares, à l'interface entre recherche académique et diagnostic clinique, avec un accès à des technologies de pointe en génomique et des opportunités de collaborations nationales et internationales.

Contraintes et risques

RAS

Rémunération et avantages

Rémunération

A partir de 3175 € brut mensuel selon experience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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Les métiers de la recherche