Missions

Contrat Postdoctoral – Diversité, structure et circulation des agents infectieux chez les goélands leucophées en Méditerranée Une position de post-doctorant (H/F) est disponible dans le cadre du projet EcoDIS "Disease ecology in a modified world : Linking combined environmental stressors, population dynamics and movement ecology to understand the circulation of infectious agents", financé par l'Agence Nationale de la Recherche (ANR). EcoDIS aborde la question des effets cumulatifs et interactifs des polluants environnementaux et des agents pathogènes sur la santé et la dynamique des populations de la faune sauvage par le biais d'une approche interdisciplinaire qui combine la démographique, l'écotoxicologie, la génétique des populations, l'épidémiologie et l'écologie des mouvements (voir ici pour plus d'informations https://tourduvalat.org/actions/ecodis-les-effets-combines-du-stress-environnemental-sur-lecologie-des-mouvements-des-oiseaux-marins-et-la-circulation-des-agents-infectieux-en-mediterranee/). Le système d'étude concerne la goéland leucophée (Larus michahellis), une espèce méditerranéenne commune et abondante qui vit fréquemment à proximité des humains. Dans le cadre du projet, le/la post-doc sera responsable pour les travaux de caractérisation de la diversité des agents infectieux dans le système, en utilisant des outils moléculaires. Ces informations seront ensuite reliées à des données complémentaires sur la démographie, la structure des populations et les mouvements des oiseaux marins (données de bio-logging).

Activités

- Mise en place et suivi du métabarcoding, qPCR et séquençage des agents infectieux (bactéries et virus) - Traitement bioinformatique et analyses de la structure génétique - Préparation de manuscrits

Compétences

- Doctorat en biologie/écologie/évolution. - Forte expérience dans le domaine du (méta)barcoding des parasites/pathogènes/biologie moléculaire (parasitologie/microbiologie/virologie) ainsi que avec les methodes de qPCR - Forte expérience avec des données NGS et des analyses bioinformatiques. - Maîtrise de l'anglais - Expérience dans la préparation de manuscrits pour la publication scientifique - Bonnes capacités de communication - Capacité à travailler en équipe - Curieux.euse, responsable, bien organisé.e et passionné.e par la science et la nature. Compétences supplémentaires souhaitables - Expérience en phylogénétique/génétique des populations

Contexte de travail

Le travail sera effectué dans l'unité de recherche MiVEGEC à Montpellier, France et dans le contexte du MEEDiN, où il y a une forte expertise en écologie de la santé et un accès facile aux plateformes et services de séquençage génomique. Il/elle travaillera au sein d'une équipe comprenant des doctorants, du personnel de soutien technique et une équipe interdisciplinaire de chercheurs du CNRS et de la Tour du Valat (Camargue). Le projet EcoDIS est réalisé en collaboration avec 4 partenaires nationaux, 4 partenaires internationaux et de nombreuses agences de gestion locales de différents pays méditerranéens.