Missions

Un poste d’ingénieur de recherche en bioinformatique est ouvert au laboratoire KidsCaN, sur la thématique des neurosciences du cancer appliquées à l’oncopédiatrie. Le laboratoire travaille sur les cancers pédiatriques d’origine embryonnaire, en particulier ceux touchant le système nerveux. Nous recherchons un ingénieur en bioinformatique avec une expertise solide en analyses omiques en particulier en transcriptomique sur cellules uniques.

Activités

Le/la candidat(e) travaillera sur l’intégration et l’analyse de jeux de données multiples, incluant mais ne se limitant pas à des données de scRNASeq, bulk RNAseq, transcriptomique spatiale et protéomique. Il assurera une veille technologique et scientifique en lien avec les thématiques de l’équipe liées aux technologies omiques. Il/elle sera également chargé d’organiser le stockage et la traçabilité des données omiques générées dans l’équipe.

Compétences

- Expertise en analyse de données omiques, en particulier en transcriptomique sur cellules uniques
- Connaissance en analyse de données de transcriptomique spatiale
- Maitrise du logiciel R
- Maitrise du langage Python ou similaire
- Maitrise de l’anglais

Contexte de travail

L'équipe fait partie d'un environnement très dynamique et international au Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), donnant accès à des équipements de pointe (microscopie, cytométrie de flux, techniques omiques en cellule unique, ...). Le CRCL comprend 26 équipes, totalisant environ 600 membres, et est affilié à l'Université Claude Bernard Lyon 1, à l'Inserm, au CNRS, au Centre Léon Bérard (CLB) et aux Hôpitaux Universitaires de Lyon (HCL). La ville de Lyon offre une excellente qualité de vie pour les jeunes chercheurs et les familles, et est idéalement située à 2h de Paris, Marseille et des Alpes.
https://www.crcl.fr/en/tumor-escape-resistance-immunity-department/kidscan-cancer-neuroscience-and-metastasis-in-pediatric-malignancies/