Chercheur en microbiologie anaérobie haute pression - H/F

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Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les matériaux

PAU • Pyrénées-Atlantiques

  • Chercheur en contrat CDD
  • 9 mois
  • Doctorat

This offer is available in English version

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'offre en un coup d'oeil

L'unité

Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les matériaux

Type de Contrat

Chercheur en contrat CDD

Temps de Travail

Complet

Lieu de Travail

64053 PAU

Durée du contrat

9 mois

Date d'Embauche

01/04/2026

Rémuneration

Entre 3041€ à 4216€ bruts mensuels selon expérience bruts mensuels selon expérience

Postuler Date limite de candidature : mercredi 4 mars 2026 23:59

Description du Poste

Les Missions

Le poste de chercheur proposé fera partie de la tâche « Modélisation de l'interaction entre les microorganismes et l'H2 dans les environnements profonds » de la chaire ORHYON. Le chercheur sera en charge des aspects microbiologiques. Trois souches microbiennes modèles ont été isolées et caractérisées : une archée méthanogène, une sulfato-réductrice et une homoacétogène. L'effet sur la croissance microbienne de différents paramètres (pressions partielles de H2 et CO2, température, salinité, etc.) sera suivi sur ces souches pures et des co-cultures, révélant ainsi les processus de compétition ou de mutualisme entre les souches. Les résultats de ces expériences seront modélisés à l'aide d'un code de calcul d'IFPEN dédié aux réactions biogéochimiques afin de déterminer les paramètres cinétiques et de les utiliser pour reproduire numériquement les expériences de laboratoire (tâche réalisée par l’IFPEN en tant que partenaire du projet). La capacité de prédiction des modèles sera ensuite évaluée en comparant les résultats des simulations de co-culture (vitesse de consommation des substrats et apparition des produits, variations de la taille des populations, etc.) avec les observations expérimentales.

Des expérimentations en cellules haute pression doivent permettre de réaliser des cultures axéniques et des co-cultures en imposant un écoulement contrôlé au sein de carottes rocheuses, simulant ainsi les transferts de fluides en milieux profonds. La modification des propriétés pétrophysiques induite par le développement microbien sera mesurée par suivi de pression lors des essais, ainsi que par tomographie aux rayons X et analyses RMN (Résonance Magnétique Nucléaire) des carottes en début et en fin d'expérimentation. Toutes les données obtenues seront utilisées pour alimenter des modèles numériques couplant écoulement et réactivité biogéochimique (le chercheur interagira avec un modélisateur).

L'Activité

Tâches principales
- Culture, caractérisation physiologique, co-culture de microorganismes anaérobies
- Suivi de croissance, suivi de l’évolution des phases aqueuses et gazeuses des cultures
- Mise au point et utilisation d’une cellule d’écoulement haute pression
- Suivi microscopique de l’état cellulaire
- Rédaction de rapports et d’articles scientifiques dans des revues internationales
- Présentation des résultats aux partenaires de la chaire
Tâches secondaires
- Collaboration avec des modélisateurs
- Collaboration avec des spécialistes en imagerie (Tomographie à Rayons X, RMN)

Votre Profil

Compétences

- Etre titulaire d’un doctorat en microbiologie
- La maîtrise de la microbiologie anaérobie est indispensable, en particulier la culture d’archées méthanogènes et de bactéries sulfato-réductrices
- Une expérience dans la manipulation de cellules ou de réacteurs haute pression
- Un fort intérêt dans la multi-disciplinarité (microbiologie, biologie moléculaire, informatique, modélisation, imagerie par tomographie à Rayons X et RMN…) et un esprit ouvert.
- Capacité à travailler en équipe (en particulier d’autres champs disciplinaires)
- Autonomie sur le sujet
- Des qualités de rédaction et de communication en anglais
- La connaissance des problématiques liées à l’hydrogène et aux microorganismes serait un plus.


Votre Environnement de Travail

La chaire industrielle ORHYON s'appuie sur les forces complémentaires d'Engie et de l'UPPA pour ouvrir la voie vers des solutions d’hydrogène durable compétitives (hydrogène naturel, stockage en UGS). Ce projet a débuté en 2020 et s’achèvera en décembre 2026. L’objectif principal est de comprendre la mobilité de l'H2 et la réactivité biochimique dans les milieux poreux naturels, des environnements profonds à la surface. Concrètement, les résultats apportés par ce projet conduisent à une meilleure compréhension des processus contrôlant la migration et la rétention de l'H2 dans les formations géologiques, mais aussi à de nouveaux outils et méthodologies pour réduire les risques liés au stockage géologique, pour préciser le potentiel de H2 en tant que ressource énergétique et fournir des conseils techniques pour son exploration et sa production.

L'IPREM regroupe plus de 300 personnes qui s’intéressent au développement de connaissances fondamentales en physico-chimie, chimie analytique et microbiologie, en relation avec des applications concernant la structure du vivant, la gestion de l’environnement et les propriétés fonctionnelles de différentes classes de matériaux.

La personne recrutée sera basée dans le bâtiment IBEAS (IPREM) au sein de l’Université de Pau et des Pays de l’Adour. Il/elle interagira avec les partenaires académiques (DMEX, IFPEN) et industriels (Engie, Storengy) de la chaire.

Rémunération et avantages

Rémunération

Entre 3041€ à 4216€ bruts mensuels selon expérience bruts mensuels selon expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

Référence de l’offre UMR5254-SOPPUY-132
Section(s) CN / Domaine de recherche Chimie et vivant

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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Chercheur en microbiologie anaérobie haute pression - H/F

Chercheur en contrat CDD • 9 mois • Doctorat • PAU

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