Missions

1- Combiner des données single cell et spatial transcriptomique pour comparer deux régions neurogéniques du cerveau adulte de souris.
2- Implémentation de méthodes de "deep learning" pour l'analyse de données single cell et imagerie obtenues dans des cerveaux de souris

Activités

- Adapter les applications informatiques aux besoins du projet
- Conseiller et former aux techniques et outils développés et rapport des résultats en réunion d'équipe
- Recherches bibliographique sur les méthodes de "deep learning" récentes en analyse transcriptomique et d'images

Compétences

- Experience en analyse bio-informatique de données transcriptomique
- Curiosité aux concepts biologiques
- Facilité d'échanger avec biologistes et bio-informaticiens

Contexte de travail

L'équipe "Logique spatio-temporelle de la neurogénèse adulte" se situe au sein de l'UMR 5242, à l'institut de Génomique fonctionnelle de Lyon (IGFL). C'est un institut pluridisciplinaire, offrant une exposition intéressante à plusieurs modèles systèmes autour de thématiques communes liées au développement, régénération, évolution et physiologie. Notre équipe s’intéresse aux mécanismes cellulaires et moléculaires permettant à des populations de cellules souches neurales distinctes de coordonner leur comportement dans l'espace et dans le temps dans le cerveau adulte.
De plus, nous proposons:
• Un environnement de travail stimulant aux contacts des personnels de la recherche
• D'excellentes conditions de travail (horaires flexibles, télétravail)
• Un restaurant d'entreprise qui permet de déjeuner à un prix intéressant
• Un site accessible en transport en commun