Informations générales
Intitulé de l'offre : Chercheur post-doctorant (H/F) en bio informatique
Référence : UMR5239-ISASER-027
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LYON 07
Date de publication : lundi 20 novembre 2023
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 février 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : à partir de 2934 euros brut mensuel selon le niveau d’expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : Biologie moléculaire et structurale, biochimie
Missions
Utiliser les approches intégratives de détermination structurale et de design de protéines pour étudier le système de sécretion de type 6 de B.FRAGILIS
Activités
Construction de modèles complets du complexe membranaire T6SS de B.FRAGILIS par intégration des données de spectrométrie de masse, de cryoEM et des structures AlphaFold2
Conception d'inhibiteurs peptidiques du T6SS pour réguler l'assemblage et moduler l'activité de sécrétion
Compétences
Le candidat idéal doit avoir une formation principalement en biophysique des macromolécules ou en bioinformatique, avec des connaissances dans un ou plusieurs des domaines suivants :
- statistiques
- informatique
- mécanique statistique
- chimie
- biologie moléculaire ou biologie cellulaire.
De solides compétences de programmation en Python sont essentielles, ainsi qu'une expérience de travail sur des systèmes UNIX et des grappes d'ordinateurs.
La maîtrise de l'anglais, tant à l'oral qu'à l'écrit, est requise.
La capacité à travailler efficacement en équipe et à collaborer avec des expérimentateurs est également indispensable.
La maîtrise de la dynamique moléculaire et/ou du machine learning sera très appréciée.
Contexte de travail
La recherche sera menée au Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule (LBMC), un institut de recherche situé sur le campus de l'Ecole Normale Supérieure (ENS) à Lyon.
Le post-doctorant fera partie de l'équipe Dynamique et Contrôle des Assemblages Biologiques et des Machines Macromoléculaires, dans le cadre du projet ANR Caméléon.
Le projet sera supervisé par Riccardo Pellarin, Paulo Telles de Souza et Juliette Martin.
La conduite du projet fera l'objet de collaborations avec l'équipe de Eric DURAND (IMM Marseille), Eduardo ROCHA (Institut Pasteur Paris), Florian STENGEL (University of Konstanz) et Ben ROSS (Darmouth School of Medicine).