Informations générales
Intitulé de l'offre : Ingénieur de Recherche en Bioinformatique (H/F)
Référence : UMR5239-CHRCHA-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LYON 07
Date de publication : mardi 11 février 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 avril 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : Entre 2875€ et 3550€ brut mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+5
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Missions
La mission consiste en :
- l’analyse de données de type « omics » (Hi-C, ChIP-Seq, MNase-Seq, etc),
- développer des approches de biologie synthétique basées sur de l’IA,
- et assister les membres de l’équipe pour la réalisation de leurs propres analyses
Activités
- Analyse et visualisation de données « omics »
- Développement d’un pipeline LLM pour la génération de séquences d’ADN artificielles
- Développement de pipelines bioinformatiques pour les besoins spécifiques de l’équipe
- Responsable de la gestion et sauvegarde des données brutes générées au laboratoire.
Compétences
Savoir-faire :
- Expertise en programmation, notamment à usage des biologistes (Python et/ou R)
- Expertise dans l’analyse de données biologiques de type « omics »
- Expertise dans le développement bioinformatique (packages)
Savoir-être :
- Capacité à travailler en équipe et répondre aux besoins de ses collègues
- Capacité à gérer plusieurs projets distincts en parallèle
Transverses :
- Capacité à se former sur de nouvelles technologies/langages
- Veille technologique dans son domaine d’expertise
Contexte de travail
Le Laboratoire de Biologie et de Modélisation de la Cellule est un centre de recherche innovant et interdisciplinaire, dédié à l’étude des bases moléculaires régissant l’organisation et le fonctionnement des processus cellulaires dans des contextes normaux et pathologiques. À l’avant-garde des sciences biologiques, il combine expertise en biologie expérimentale et modélisation computationnelle pour déchiffrer les mécanismes fondamentaux de la vie.
L’équipe « mécanique du génome » s’intéresse au processus de réparation des cassures de l’ADN par recombinaison homologue, et son intersection avec l’organisation spatiale de la chromatine dans le noyau. Ils mobilisent des approches de génomique à haut-débit dans l’organisme modèle S. cerevisiae.
• 44 jours de congés / RTT par an
• D'excellentes conditions de travail
• Un contrat de 12 mois
• Le remboursement partiel des titres de transport (75%) + forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an
• Participation financière au frais de mutuelle