Missions

• Organiser et contribuer à l’analyse des données IRM fonctionnelles.
• Assurer la traçabilité, la gestion et la sauvegarde des données.
• Participer à la mise à jour des pipelines d’analyse.
• Contribuer à la rédaction de rapports et figures scientifiques pour les livrables du projet et publications.
• Participer à la préparation des sessions IRM anesthésiées (coordination logistique, préparation des protocoles, suivi des données).
• Assister ponctuellement les équipes partenaires à Marseille pour les acquisitions IRM (préparation, suivi technique).

Activities

• Prétraiter et analyser les données IRM fonctionnelles issues d’un suivi longitudinal chez le macaque (rs-fMRI).
• Mettre en œuvre et adapter les pipelines d’analyse (AFNI, FSL, ANTs, Workbench, Python/MATLAB) selon les besoins scientifiques.
• Appliquer des modèles statistiques de connectivité fonctionnelle (LME, ICA, seed-based analyses) pour l’étude du développement cérébral et de ses altérations.
• Participer à la préparation, au suivi et à la gestion des sessions d’acquisition IRM anesthésiées (en lien avec les équipes partenaire).
• Assurer la qualité, la traçabilité et la sauvegarde des données sur les serveurs du CNRS (documentation, archivage).
• Générer les figures, tableaux et rapports nécessaires aux livrables scientifiques et publications du projet.
• Participer aux réunions de coordination entre partenaires et aux échanges réguliers sur les analyses en cours.
• Contribuer à la veille méthodologique et au transfert de compétences au sein de l’équipe (formation des étudiants, mise à jour des outils).

Skills

• Licence (master apprécié) en neurosciences, neuroimagerie ou traitement du signal
• Maîtrise des outils d’analyse de données IRM (FSL, AFNI, SPM, Workbench, Python ou MATLAB).
• Connaissances des approches de connectivité fonctionnelle et/ou de modélisation statistique (GLM, LME, ICA).
• Bonnes pratiques de gestion de données et de reproductibilité (Git, scripts, documentation).
• Capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire (neurosciences, imagerie, éthologie).
• Interactions fréquentes avec plusieurs équipes et plateformes techniques, demandant une bonne capacité d’adaptation, de communication et de coordination.
• Autonomie, rigueur, et sens de l’organisation.
• Bon niveau d’anglais scientifique.
• Une expérience préalable en neuroimagerie animale (macaque ou rongeur) seront des atouts appréciés.

Work Context

Le poste est basé à l’Institut des Sciences Cognitives Marc Jeannerod (CNRS, Lyon), dans l’équipe dirigée par le Pr. Suliann Ben Hamed.
L’ingénieur·e participera à un projet financé par l’ANR, qui explore les effets de l’adversité sociale précoce sur le développement cérébral et comportemental du macaque. Des déplacements ponctuels à l’Institut de Neurosciences de la Timone (Marseille) sont à prévoir.

Constraints and risks

• Travail en environnement de recherche biomédicale et primatologique, nécessitant le respect strict des règles d’hygiène, de sécurité et de confidentialité.
• Accès ponctuel à des plateformes d’imagerie IRM 3T et à des zones expérimentales soumises à des procédures spécifiques (autorisation d’accès, formation sécurité, conformité éthique).
• Déplacements occasionnels pour la préparation et le suivi des sessions d’imagerie sous anesthésie.
• Contraintes horaires ponctuelles liées aux calendriers d’acquisition et à la coordination inter-sites.
• Exposition à des données sensibles imposant une vigilance particulière en matière de sécurité informatique et de confidentialité.