Ingénieur de recherche en développement et déploiement d'applications pour la plateforme VIP H/F

Job Description

Missions

La principale mission portera sur des développements logiciel permettant d’intégrer VIP dans l’écosystème EOSC DC et notamment l’interaction avec les modules Matchmaker, Dispatcher et Data Player développés dans le cadre du projet. En parallèle, une deuxième mission sera la prise en main des outils SRM pour une meilleure intégration dans l’écosystème EOSC DC.
D’autres missions ponctuelles de communication et support utilisateurs peuvent être envisagées au sujet des services proposées par VIP dans le cadre de EOSC DC.

Activity

La mission de développement logiciel comprend les activités suivantes :
• Analyse des besoins et conception
o Compréhension de VIP et des modules développés dans EOSC DC
o Analyse des besoins et des solutions techniques pour l'intégration de VIP dans l’écosystème EOSC DC
o Choix des solutions à mettre en œuvre et cahier des charges
• Développement et tests de logiciels
o Mise en œuvre de la ou des solutions choisies
o Mise en place des tests associés
o Intégration continue (CI)
La mission de prise en main des outils SRM comprend les activités suivantes :
• Compréhension du use-case SRM
• Prise en main des outils LCModel, CQuest et des codes de preprocessing
• Analyse des besoins
o Format et accessibilité des données
o Fonctionnalités attendues dans le cadre de EOSC DC
• Développement et déploiement des solutions adaptées
Les missions de communication et support utilisateurs comprend les activités suivantes :
o Participer à des réunions/conférences à l’étranger
o Support régulier pour les utilisateurs (répondre aux demandes/questions adressées par les utilisateurs à travers le formulaire de contact VIP)

Your Profil

Skills

• Diplôme Bac +5 minimum (Master, diplôme d’ingénieur, doctorat ou équivalent), spécialisée en informatique
• Expérience en développement logiciel (Java, Python, Shell)
• Expérience avec IntelliJ ou d'autres IDE, avec git et GitHub/Gitlab
• Expérience avec les systèmes d'exploitation Linux
• Connaissances dans le domaine du traitement de signal/images
• La connaissance de la SRM serait un plus
• Rigueur, autonomie, curiosité technique, passion pour les nouvelles technologies
• Bonne maîtrise de l'anglais technique et scientifique

Your Work Environment

VIP (Virtual Imaging Platform) est un portail web (https://vip.creatis.insa-lyon.fr) pour la simulation et le traitement de données massives en imagerie médicale. En exploitant efficacement les ressources de calcul et stockage de l’infrastructure européenne EGI, VIP offre à ses utilisateurs des services de haut niveau leur permettant d’exécuter simplement et de manière distribuée des applications d’imagerie médicale. VIP compte, en 2026, plus de 1500 utilisateurs enregistrés et une vingtaine d’applications ouvertes à tous ses utilisateurs.
VIP participe au projet européen EOSC (European Open Science Cloud) Data Commons (https://www.eosc-data-commons.eu/), qui contribue à faire de l'EOSC le « European Research Commons », un écosystème mondial fiable qui offre un accès transparent à des résultats et services de recherche interopérables de haute qualité, permettant ainsi aux chercheurs européens de collaborer plus facilement et d'atteindre des niveaux d'excellence plus élevés.
Dans le cadre de ce projet, VIP est impliqué à travers un cas d’usage en spectroscopie par résonance magnétique (SRM). La SRM est une technique d'imagerie médicale qui exploite les propriétés magnétiques des tissus biologiques pour déterminer leur composition chimique. En particulier, nous pouvons utiliser le signal de résonance magnétique pour estimer in vivo la concentration de certains métabolites à certains endroits dans le corps (par exemple, une région du cerveau). Cela nécessite des protocoles d'acquisition spécifiques et des pipelines de reconstruction et de quantification qui doivent être étudiés afin d'accroître la robustesse, la reproductibilité et la fiabilité des mesures.
Le cas d’utilisation VIP - SRM dans le cadre de EOSC DC couvre l'ensemble du cycle de vie des données SRM, depuis leur acquisition jusqu'à leur stockage, leur gestion, leur analyse et leur réutilisation. Les données sont acquises sur la plateforme PILoT et stockées dans un entrepôt Girder avec les métadonnées associées. Elles sont ensuite traitées à l'aide des outils disponibles sur VIP et les résultats sont renvoyés vers l'entrepôt Girder.
L’ingénieur sera accueilli au laboratoire CREATIS (https://www.creatis.insa-lyon.fr) et rémunéré par le CNRS en tant que IR BAP E. Il sera intégré dans la plateforme VIP et interagira avec les autres ingénieurs VIP et les chercheurs en SRM, les autres membres du laboratoire CREATIS, ainsi que nos partenaires aux niveaux national et européen.

Compensation and benefits

Compensation

A partir de 3175€ brut mensuel selon expérience

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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