Missions

L’imagerie par Résonance Magnétique (IRM) est une technique d’imagerie non invasive et non irradiante qui permet d’acquérir une grande variété de contrastes (informations physiologiques, anatomiques, métaboliques) en fonction de la « structure/organe » cible. Ces contrastes sont extrêmement utiles aux chercheurs et praticiens hospitaliers, biologiste ou médecin pour comprendre les mécanismes des pathologies. Un pan très important et extrêmement dynamique de la recherche en IRM consiste à identifier de nouveaux contrastes ainsi qu’à optimiser la quantité et la qualité de l’information présente dans les contrastes déjà existants. Par contre, pour des raisons de maintenance et de protection de ces équipements, le fabricant ne déploie de nouveaux contrastes sur ses systèmes que tardivement et l’utilisateur n’a accès qu’à un ensemble extrêmement restrictif de mécanismes de réglages, acquisition et de pré-traitement. Cette dichotomie illustre la divergence entre les outils que veut fournir le constructeur et le besoin des chercheurs de développer ou d’avoir à leur disposition des contrastes ‘state of the art’.
Le contexte de ce travail est de contourner cette limitation en mettant en place une librairie (via une API) de pilotage et d’échange de données suffisamment générique et robuste pour que les mécanismes de réglages, acquisition et prétraitement trop complexes pour être réalisés sur les IRM soient pilotés et exécutés en « temps réel » sur des ordinateurs déportés. L’utilisateur pourra ainsi tester son travail développé avec ses outils et langages de prédilection sans possibilité de « perturber/endommager » l’environnement certifié de la machine d’acquisition.

Activités

La librairie que nous voulons développer vise (tout en respectant la protection des sujets et de la machine) au transfert du contrôle des IRM vers des ordinateurs déportés pour faciliter l’implémentation et le test des toutes dernières fonctionnalités développées par les chercheurs. La mission de la personne recrutée sera de :
• Modéliser, concevoir et/ou paramétrer tout ou partie de la solution logicielle.
• Développer et tester les objets et composants de cette interface client/serveur permettant de faire transiter bilatéralement en temps réel des informations entre une IRM préclinique sous GCC 4.8.5 et un ordinateur déporté disposant des versions courantes de Python,C/C++, Matlab, Julia, …
• Rédiger les documentations techniques et fonctionnelles.
• Élaborer la stratégie de test, concevoir, spécifier et exécuter des tests fonctionnels et/ou techniques.
• Créer et tester les packages applicatifs et les scripts de déploiement en production.

Compétences

Le candidat devra posséder des bases extrêmement solides de développement en C/C++ et Python, de bonnes connaissances en communication inter-processus (IPC) et aussi des bases en Matlab et éventuellement Julia.
La formation plus spécifique liée à l’acquisition de données IRM sur un environnement propriétaire sera assurée sur place par des spécialistes du domaine.

Contexte de travail

Le laboratoire CREATIS est un centre de recherche spécialisé dans l'imagerie médicale et la modélisation. Situé à Lyon, en France, il est reconnu pour son expertise dans le développement de technologies innovantes pour la santé. CREATIS se distingue par son engagement à la fois dans la recherche fondamentale et dans des projets appliqués, visant à améliorer les diagnostics et les traitements médicaux. Avec une équipe dynamique et multidisciplinaire, le laboratoire CREATIS offre un environnement stimulant et collaboratif, propice à l'épanouissement professionnel et à la réalisation de projets novateurs dans le domaine de la santé.

Ce que nous proposons :
· Un CDD de 12 mois renouvelable
· Une rémunération à partir de 2 304€ brut mensuel selon expérience
· Un environnement de travail stimulant aux contacts des personnels de la recherche
· Une possibilité de télétravailler
· Un restaurant d'entreprise qui permet de déjeuner à un prix intéressant.
· Le remboursement partiel des titres de transport (75%) + forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an
· Un site accessible en transport en commun
· 44 jours de congés / RTT par an
· Participation financière au frais de mutuelle
· Un comité d'entreprise (Centre de Loisirs Educatifs, crèche, activités à prix réduits (cinéma, concert,…))

Contraintes et risques

Aucun

Informations complémentaires

Encadrement:
Denis Grenier, responsable opérationnel des IRM précliniques

Frédéric Cervenansky, responsable du service informatique et développement