Ingénieur de recherche en bio-informatique H/F

Job Description

Missions

Le cancer est une maladie hétérogène, chaque tumeur évoluant comme un système multicellulaire autonome. L'écosystème tumoral est constitué de cellules d'origines et d'identités différentes qui interagissent dynamiquement les unes avec les autres. Il est difficile d'observer et de quantifier l'hétérogénéité de la composition tumorale, un facteur clé contribuant à la progression du cancer.
Notre incapacité actuelle à estimer l'hétérogénéité dans un échantillon donné a entravé notre compréhension de sa fonction au cours des processus oncogènes.

L'ingénieur.e recruté.e contribuera au développement de nouvelles méthodes scientifiques visant à estimer l'hétérogénéité tumorale à partir de données omiques (transcriptomes et méthylomes) Il/elle participera également au maintien des outils existants (notamment en mettant en place de bonnes pratiques de biocomputing et des procédures standardisées de traitement des données).

Activity

- Développement de méthodes biostatistiques pour l’analyse de l’hétérogénéité tumorale
- Analyse de données en cellule unique
- Management des ressources computationnelles de l’équipe (maintenance des projets en cours, formation des nouveaux arrivants, organisation des ressources de stockage et de calcul scientifique, data management)
- Veille technologique sur les développements méthodologiques en lien avec les activités de recherche de l’équipe
- Animation du réseau BIGRE

Your Profil

Skills

• Doctorat en bio-informatique ou biologie computationnelle ; Master en bio-informatique ou bio-statistique.
• Des compétences en programmation (R, Python, bash), une expérience préalable avec des logiciels d'analyse et les packages associés
• Des connaissances en informatique, data management et développement de projets collaboratifs
• Des connaissances en biologie
• Capacité à communiquer en anglais parlé et écrit
• Autonome et rigoureux.se avec un esprit critique, capacité à gérer et à analyser des ensembles de données volumineux et variés, avec des informations biologiques et cliniques
• Bonnes compétences en communication permettant des interactions productives avec une équipe interdisciplinaire (y compris des informaticiens, des biologistes et des cancérologues)

Your Work Environment

Le Laboratoire d’Informatique de Grenoble (LIG) est un laboratoire d’envergure, dont les partenaires académiques sont : l’Université Grenoble Alpes, Grenoble INP - UGA, le CNRS et Inria.
Le LIG rassemble près de 500 chercheurs, enseignants-chercheurs, doctorants et personnels en support à la recherche. Ils relèvent des différents organismes et sont répartis sur trois sites du LIG : le campus, Minatec et Montbonnot.

L’ambition est de s’appuyer sur la complémentarité et la qualité reconnue des 22 équipes de recherche du LIG pour contribuer au développement des aspects fondamentaux de l'informatique (modèles, langages, méthodes, algorithmes) et pour développer une synergie entre les défis conceptuels, technologiques et sociétaux associés à cette discipline.

Constraints and risks

/

Compensation and benefits

Compensation

À partir de 3 143,64 €, selon l’expérience et la grille salariale en vigueur

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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