Ingénieur de recherche biologiste en traitement de données (H/F)

Job Description

Missions

Le candidat (H/F) aura pour mission principale, sous la responsabilité d’un chercheur d'Edytem (Yves PERRETTE) de réaliser le traitement des données de séquençage 16S pour du métabarcoding obtenues dans le cadre du projet Biokarst financé par l'agence de l'eau Rhône Méditerranée Corse.
Plus spécifiquement, les missions de l’agent seront l'analyse des données déjà acquises et leur valorisation sous forme de publications scientifiques ;

Activity

• Réaliser les traitement bioinformatiques
• Analyser et présenter les résultats aux membres du projet Biokarst
• Diffuser et valoriser les données sous forme de rapports techniques et de publications scientifiques

Your Profil

Skills

Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires :
• Connaissances des microbiomes associés au milieu souterrain karstique
• Connaissances des méthodologies de bio informatique pour le traitement des données issues de séquençage 16S pour du métabarcoding
• Outils informatiques (traitement de texte, tableur, R)
• Langue anglaise : B1 à B2 selon le cadre européen commun de référence pour les langues

Savoir-faire opérationnels :
• Interagir avec les biologistes du laboratoire
• Interagir avec des partenaires non académiques
• Assurer une veille scientifique
• Travailler avec méthode et rigueur
• Transmettre des connaissances
• Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
• Appliquer les règles d’hygiène et de sécurité

Your Work Environment

Ce projet est financé dans le cadre du projet Biokarst financé par la zone atelier bassin du rhône et l'agence de l'eau Rhône Mediterranée Corse. La ou le candidat sera encadré par Yves PERRETTE (Edytem) et Florian MERMILLOD-BLONDIN chercheur au Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés de Lyon.
Le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) est un organisme public de recherche français dont les laboratoires (et les chercheurs, ingénieurs et personnels de soutien) sont répartis sur tout le territoire. L’ingénieur(e) de recherche sera intégré(e) à l’équipe de recherche « Zone Critique » de l’unité EDYTEM (« Environnements, Dynamiques et Territoires de Montagne » ; Le Bourget-du-Lac, France) ainsi qu'au pôle d'analyses. L'activité se déroulera sur deux sites : à EDYTEM (Le Bourget du Lac) et au LEHNA (Lyon).
L’unité de recherche EDYTEM fait partie de l’Université Savoie Mont-Blanc (USMB), l’une des principales institutions académiques de la région Auvergne-Rhône-Alpes. Le campus du Bourget-du-Lac, où est située EDYTEM, est idéalement placé pour les activités de plein air, à proximité du lac du Bourget, entre Chambéry et Aix-les-Bains. Il offre une large gamme d’activités sportives, de loisirs et d’événements culturels proposés par l’université.

Constraints and risks

Sans contraintes et risques particuliers.

Compensation and benefits

Compensation

entre 3143€ et 4541,08 € bruts mensuels selon l'expérience

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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