CDD postdoctoral (H/F) - Dynamiques éco-évolutives des métacommunautés de gastéropodes invasifs d’eau douce

Description du Poste

Les Missions

CONTEXTE:
Comprendre la biodiversité et sa dynamique est l'une des questions les plus cruciales de notre époque, dans un contexte inquiétant de l’effondrement de la biodiversité. Pour y contribuer, le projet ECO-EVO BIODIV propose de développer une approche éco-évolutive intégrative. Le cadre général du projet inclut les principales facettes de la biodiversité (niveaux de biodiversité, groupes biologiques et variabilité), les forces et les processus qui les façonnent, leur cadre spatio-temporel et leur environnement. ECO-EVO BIODIV est basé sur une large gamme de corpus conceptuels, approches et méthodes dans une perspective interdisciplinaire.
Dans le cadre de ECO-EVO BIODIV, le travail proposé pour ce post-doctorat vise à comprendre comment les interactions intraspécifiques et interspécifiques interagissent pour façonner la dynamique de métacommunautés et d’écosystèmes, via les processus de compétition et de prédation. Ce travail s’appuie sur un cas d’étude : les métacommunautés de gastéropodes d’eau douce de Martinique qui font l’objet d’un suivi depuis plusieurs décennies en près de 200 sites. Elles sont dominées par deux espèces de Thiaridae invasifs, en interactions compétitives, en partie via la ressource alimentaire (biofilm sur les rochers). Phylogénétiquement et écologiquement proches, ces espèces se reproduisent clonalement (les clones peuvent être distingués visuellement). La dynamique des espèces et clones est très rapide, en densité ou nombre de sites occupés. Ces espèces sont, depuis peu, soumises à la prédation par une écrevisse elle-même invasive. Dans ce contexte d’interactions biotiques (compétition et prédation), l’objectif est de caractériser les tendances démographiques et de quantifier les interactions intraspécifique et interspécifique, en prenant en compte la variation environnementale, spatiale et temporelle.

MISSIONS:
Le travail est basé sur des approches d’analyses de données et de modélisation. Une première phase consistera en la prise en main du système d’étude et des données disponibles. Il s’agira ensuite de développer des modèles dynamiques permettant d’estimer les forces d’interaction entre espèces et clones de Thiaridae sur la base des dynamiques observées, et de relier ces processus à la dynamique évolutive. On envisage pour cela d’adapter des modèles multivariés autorégressifs pour des données en classes de densité, tout en portant une attention particulière à connecter les estimations à l’interprétation en termes de coexistence et d’évolution rapide. Cette approche sera comparée aux estimations préexistantes de la valeur sélective relative des espèces / clones d’escargots, en tirant profit des transitions temporelles des espèces / clones au sein des sites. Un autre aspect de ce travail consistera à introduire dans les modèles spatialisés des flux potentiels entre les divers sites, en respectant la structure spatiale particulière induite par les réseaux de rivières.

L'Activité

- Nettoyage, structuration et analyse des données historiques de suivi long terme collectées (ca. 200 sites).
- Adaptation et mise en œuvre de modèles multivariés autorégressifs adaptés aux données en classes de densité pour quantifier l'effet des interactions sur la dynamique des espèces et des clones.
- Développement de modèles spatialisés incorporant la connectivité spatiale et les flux potentiels d'individus le long de la structure en réseau des cours d'eau.
- Comparaison des estimations issues des modèles avec les données préexistantes de valeur sélective relative des clones/espèces, afin d'évaluer les mécanismes de coexistence.
- Rédaction d'articles scientifiques, présentations dans des congrès, participation aux missions de terrain en Martinique et échanges avec les partenaires académiques ou acteurs locaux.

Votre Profil

Compétences

La personne doit être titulaire d’un doctorat dans les domaines de l’écologie ou de la biologie évolutive, ou des biostatistiques / biomathématiques.

Compétences requises :
- Analyses de données en R et manipulation de base de données
- Modélisation statistique pour l’écologie et l’évolution (« occupancy models », dynamique de populations multi-espèces, modèles autorégressifs…)
- Capacité à travailler de façon indépendante et en équipe
- Goût pour la théorie écologique et évolutive
- Expérience de rédaction scientifique (articles, rapports)
- Très bon niveau de communication (écrite et orale) en français et anglais

Compétences utiles :
- Connaissances sur les invasions biologiques
- Expérience de la modélisation des systèmes aquatiques
- Expérience de terrain
- Capacité à interagir avec des interlocuteurs non scientifiques

Votre Environnement de Travail

Le travail sera mené au Cefe à Montpellier (France ; https://www.cefe.cnrs.fr), en collaboration étroite avec l’IMB à Bordeaux (France, https://www.math.u-bordeaux.fr/; des séjours réguliers à Bordeaux seront nécessaires), selon les règles de fonctionnement (par ex., horaires, congés) du CNRS et de l’Université de Bordeaux. Le Cefe est l’un des plus grands laboratoires d’écologie français, et un endroit particulièrement approprié pour mener des travaux interdisciplinaires en éco-évolution. Le projet ECO-EVO BIODIV est porté au sein de l’équipe Génétique et Ecologie Evolutive (GEE) du Cefe (https://www.cefe.cnrs.fr/fr/recherche/ee/gee).

Temps de travail complet (100%). La personne recrutée aura l’opportunité de participer à des missions de terrain en Martinique. Elle mènera ces travaux sous la direction de Philippe Jarne (Montpellier) et de Frédéric Barraquand (Bordeaux). Elle interagira avec d’autres personnes directement impliquées dans l’étude du système Martiniquais, à Montpellier, Poitiers et Lyon, ainsi qu’avec les membres de l’équipe d’accueil à Montpellier. Elle participera à toute la chaine de travail, de la conception à la publication.

Contraintes et risques

Déplacements réguliers prévus en France métropolitaine (Bordeaux). Mission de terrain aux Antilles. Respect des règles de fonctionnement (hygiène & sécurité, …) sur le terrain.

Rémunération et avantages

Rémunération

A partir de 3071,50€ et selon expériences professionnelles

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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