CDD Chercheur Evolution des compensations de dosage des chromosomes sexuels (H/F)

Description du Poste

Les Missions

Les chromosomes sexuels ont évolué indépendamment chez un grand nombre d'espèces et présentent des caractéristiques communes, notamment la suppression de la recombinaison, la dégénérescence et la compensation du dosage. Ces caractéristiques ne sont toutefois pas universelles et de nombreuses espèces dont les chromosomes sexuels en sont dépourvus ou ne les présentent que partiellement. La compensation de dosage, en particulier, s'opère selon différents mécanismes et peut être locale (au niveau de chaque gène) ou régionale/globale (au niveau chromosomique ou d'une partie des chromosomes) (1–7). De nouveaux modèles développés par notre équipe (10–12) suggèrent un rôle important des changements de régulation et de la compensation de dosage au cours de l’évolution précoce des chromosomes sexuels. Cependant, l’évolution des différentes formes de compensation de dosage et la transition d’une compensation locale à une compensation globale ont été peu étudiées et restent une énigme. Nous ne disposons pas d’une théorie solide permettant de comprendre comment une compensation de dosage globale peut évoluer. Le projet de recherche est de développer une telle théorie en utilisant les modèles existants comme éléments de base et de les développer davantage.

References:
1. C. H. Chandler, When and why does sex chromosome dosage compensation evolve? Annals of the New York Academy of Sciences 1389, 37–51 (2017).
2. B. Charlesworth, The evolution of chromosomal sex determination and dosage compensation. Current Biology 6, 149–162 (1996).
3. B. Charlesworth, D. Charlesworth, HJ Muller and the Relationship Between Sex Chromosome Degeneration and the Evolution of Dosage Compensation. Genome Biol Evol 17, evaf195 (2025).
4. C. M. Disteche, Dosage compensation of the sex chromosomes. Annual review of genetics 46, 537–560 (2012).
5. A. Muyle, R. Shearn, G. A. Marais, The evolution of sex chromosomes and dosage compensation in plants. Genome Biology and Evolution 9, 627–645 (2017).
6. I. Marin, M. L. Siegal, B. S. Baker, The evolution of dosage-compensation mechanisms. BioEssays 22, 1106–1114 (2000).
7. J. E. Mank, Sex chromosome dosage compensation: Definitely not for everyone. Trends in Genetics 29, 677–683 (2013).
8. T.-L. Ashman, D. Bachtrog, H. Blackmon, E. E. Goldberg, M. W. Hahn, M. Kirkpatrick, J. Kitano, J. E. Mank, I. Mayrose, R. Ming, S. P. Otto, C. L. Peichel, M. W. Pennell, N. Perrin, L. Ross, N. Valenzuela, J. C. Vamosi, Tree of Sex: A database of sexual systems. Scientific Data 1, 140015 (2014).
9. L. W. Beukeboom, N. Perrin, The Evolution of Sex Determination (Oxford University Press, 2014; http://www.oxfordscholarship.com/view/10.1093/acprof:oso/9780199657148.001.0001/acprof-9780199657148).
10. T. Lenormand, F. Fyon, E. Sun, D. Roze, Sex chromosome degeneration by regulatory evolution. Current Biology 30, 3001-3006.e5 (2020).
11. T. Lenormand, D. Roze, Y recombination arrest and degeneration in the absence of sexual dimorphism. Science 375, 663–666 (2022).
12. T. Lenormand, D. Roze, Can mechanistic constraints on recombination reestablishment explain the long-term maintenance of degenerate sex chromosomes? Peer Community Journal 4, e17 (2024).

L'Activité

Le travail sera basé sur des simulations C++ à l'échelle du chromosome et sur un travail analytique si possible. La personne recrutée sera également impliquée dans plusieurs projets de recherche de doctorat sur l’évolution des régulateurs, qui utilisent des méthodes similaires et qui comprennent également l'analyse de données génomiques. Par conséquent, dans l'idéal, la personne aura une certaine expérience à la fois de la génétique théorique des populations et des analyses de données génomiques.

Votre Profil

Compétences

(1) Enthousiasme et véritable curiosité pour la génétique évolutive, la génomique et la biologie évolutive.
(2) Thèse en biologie évolutive. Une expérience en génétique des populations théorique, génétique des populations et/ou génomique est souhaitable.
(3) Solides compétences quantitatives. Une expérience de la programmation ou de la bioinformatique est souhaitable.
(4) Solides compétences en communication orale et écrite en anglais (la langue de travail pour les sciences au CEFE est l'anglais).
(5) Capacité à travailler aussi bien de manière autonome que dans un environnement fortement axé sur la collaboration.
(6) Sens de l'organisation et forte motivation.

Votre Environnement de Travail

La personne recrutée recevra une formation de pointe en génétique théorique des populations. Elle passera la plupart de son temps dans le groupe d'écologie génétique et évolutive (GEE) du Centre d'écologie fonctionnelle et évolutive (CEFE), un grand institut de recherche axé sur l'écologie et l'évolution situé à Montpellier, dans le sud de la France, avec d'éventuelles visites de partenaires du projet ailleurs en France. Montpellier est une ville étudiante animée avec un beau centre historique, située à environ 10 km de la mer Méditerranée. Ce poste fait partie d'un projet ERC avancé ('RegEvol', Thomas Lenormand), qui aborde de nouvelles idées et prédictions théoriques sur le rôle de l'évolution des régulateurs de l’expression génétique pour plusieurs sujets fondamentaux importants en biologie évolutive (chromosomes sexuels, maintien du sexe, complexité des réseaux de gènes, etc.). La personne recrutée rejoindra l'équipe travaillant sur ce projet, comprenant Christoph Haag, Denis Roze, Sylvain Glémin, et Thomas Lenormand ainsi que les autres personnes recrutées sur ce projet.

Contraintes et risques

Il n'y a pas de risque spécifique

Rémunération et avantages

Rémunération

A partir de 3 071,50€ brut mensuel et évolutif selon expériences acquises

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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