Ingénieur d'études biologiste en traitement des données (H/F)
New
- IT in FTC
- 10 mounth
- BAC+3/4
This offer is open to people with a document recognizing their status as a disabled worker.
Offer at a glance
The Unit
Laboratoire Génome et Développement des Plantes
Contract Type
IT in FTC
Working hHours
Full Time
Workplace
66860 PERPIGNAN
Contract Duration
10 mounth
Date of Hire
01/06/2026
Remuneration
A partir de 2521,95 € brut mensuel, ajustable en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent
Apply Application Deadline : 15 April 2026 23:59
Job Description
Missions
Au cours de cette mission vous participerez à l’analyse bioinformatique de la dynamique du génome dans des plantes soumises à des stress environnementaux pour mieux comprendre l’adaptation des plantes au changement climatique.
Activity
• Vous serez en charge de la caractérisation des variants structuraux à partir de données de séquençage Nanopore dans une population de hêtres, dans le cadre du projet PEPR "Tools for Adapt"
• Vous participerez à l’assemblage de génomes de hêtre à partir de données ProméthION Nanopore et à la réalisation d'un pan-génome de la population étudiée.
• Vous contribuerez à améliorer des outils et pipelines dédiés à l’analyse et à l’assemblage des ADNecc et des SV.
Your Profil
Skills
• Maitrise des outils bioinformatiques pour l'analyse des données NGS.
• Expérience d’utilisation de données génomiques en lectures longues (Nanopore par exemple). Une expérience en variations structurales serait un plus.
• Très bonnes capacités rédactionnelles et aisance à l’oral.
• Capacités relationnelles et interculturelles.
• Capacités organisationnelles.
• Niveau de maitrise de l'anglais C1-C2.
Your Work Environment
L’équipe mixte de recherche EMR269 « MANGO » s’intéresse aux mécanismes génomiques de l’adaptation chez les plantes, il s’agit d’une équipe mixte entre l’IRD, le CNRS et l’Université de Perpignan. Elle fait partie du Laboratoire « Génome et Développement des Plantes » et est basée sur le campus de l’Université de Perpignan. L’EMR MANGO travaille sur plusieurs modèles végétaux (Arabidopsis, hêtre, riz, inule) et se caractérise par le développement de protocoles adaptés à l’utilisation des lectures longues Nanopore pour la génomique et la transcriptomique ainsi que le développement d’outils bioinformatiques dédiés. L’équipe est financée par des projets ANR ainsi que par le Labex TULIP.
Compensation and benefits
Compensation
A partir de 2521,95 € brut mensuel, ajustable en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent
Annual leave and RTT
44 jours
Remote Working practice and compensation
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
About the offer
| Offer reference | UMR5096-OLIPAN-001 |
|---|---|
| Line of business | Life, Earth and Environmental Sciences |
| Job Type | Biological Engineer in Data Processing |
About the CNRS
The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.
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