Ingénieur d'études biologiste en traitement des données (H/F)
Nouveau
- IT en contrat CDD
- 10 mois
- BAC+3/4
Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Laboratoire Génome et Développement des Plantes
Type de Contrat
IT en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
66860 PERPIGNAN
Durée du contrat
10 mois
Date d'Embauche
01/06/2026
Rémuneration
A partir de 2521,95 € brut mensuel, ajustable en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent
Postuler Date limite de candidature : mercredi 15 avril 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
Au cours de cette mission vous participerez à l’analyse bioinformatique de la dynamique du génome dans des plantes soumises à des stress environnementaux pour mieux comprendre l’adaptation des plantes au changement climatique.
L'Activité
• Vous serez en charge de la caractérisation des variants structuraux à partir de données de séquençage Nanopore dans une population de hêtres, dans le cadre du projet PEPR "Tools for Adapt"
• Vous participerez à l’assemblage de génomes de hêtre à partir de données ProméthION Nanopore et à la réalisation d'un pan-génome de la population étudiée.
• Vous contribuerez à améliorer des outils et pipelines dédiés à l’analyse et à l’assemblage des ADNecc et des SV.
Votre Profil
Compétences
• Maitrise des outils bioinformatiques pour l'analyse des données NGS.
• Expérience d’utilisation de données génomiques en lectures longues (Nanopore par exemple). Une expérience en variations structurales serait un plus.
• Très bonnes capacités rédactionnelles et aisance à l’oral.
• Capacités relationnelles et interculturelles.
• Capacités organisationnelles.
• Niveau de maitrise de l'anglais C1-C2.
Votre Environnement de Travail
L’équipe mixte de recherche EMR269 « MANGO » s’intéresse aux mécanismes génomiques de l’adaptation chez les plantes, il s’agit d’une équipe mixte entre l’IRD, le CNRS et l’Université de Perpignan. Elle fait partie du Laboratoire « Génome et Développement des Plantes » et est basée sur le campus de l’Université de Perpignan. L’EMR MANGO travaille sur plusieurs modèles végétaux (Arabidopsis, hêtre, riz, inule) et se caractérise par le développement de protocoles adaptés à l’utilisation des lectures longues Nanopore pour la génomique et la transcriptomique ainsi que le développement d’outils bioinformatiques dédiés. L’équipe est financée par des projets ANR ainsi que par le Labex TULIP.
Rémunération et avantages
Rémunération
A partir de 2521,95 € brut mensuel, ajustable en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR5096-OLIPAN-001 |
|---|---|
| Secteur d’activité | Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement |
| Emploi type | Ingenieur biologiste en traitement de donnees (H/F) |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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