Ingénieur d’études (H/F) en microbiologie moléculaire

Job Description

Missions

Ce poste d’Ingénieur d’Études (H/F) s’inscrit dans le cadre du projet ANR PHENICS, qui vise à décrypter les bases moléculaires de l’hétérogénéité phénotypique chez la bactérie Streptococcus pneumoniae, un pathogène humain majeur. L’objectif est de comprendre comment l’émergence de sous-populations bactériennes aux propriétés distinctes permet à une population génétiquement identique de survivre à des stress variés, tels que l’exposition à des antibiotiques.

Activity

- Utiliser au quotidien des techniques classiques de biologie moléculaire (PCR, mutagenèse, clonage, etc)
- Mettre en œuvre des approches de génétique bactérienne pour la construction, la sélection et la caractérisation de souches mutantes de S. pneumoniae
- Mettre en œuvre une approche de screening génétique à haut débit fondée sur la technologie CRISPRi/Cas9, incluant la construction et la validation de librairies dans plusieurs fonds génétiques de référence chez S. pneumoniae, et leur utilisation dans différents contextes expérimentaux
- Réaliser en routine des expériences de microbiologie tels que le suivi de croissance et l’analyse de viabilité de souches mutantes
- Réaliser des observations de souches mutantes en microscopie à contraste de phase et épifluorescence
- Etablir des profils de phosphorylation et préparer des échantillons en vue de leur analyse par phosphoprotéomique sur une plateforme dédiée
- Assurer la traçabilité des expériences, rédiger des protocoles, analyser les données obtenues et participer à l’interprétation et la rédaction des résultats

Your Profil

Skills

- Un diplôme de master ou ingénieur en microbiologie / biotechnologie / génétique / biologie moléculaire et cellulaire ou domaine similaire, serait apprécié
- Maîtrise indispensable des techniques de base en microbiologie et biologie moléculaire
- Solides connaissances en génétique bactérienne
- Expérience souhaitée dans la construction et validation de librairies CRISPRi pour des approches de screening génétique
- Une expérience en microscopie serait un plus
- Bonne maîtrise de l'anglais scientifique à l'écrit et à l'oral
- Grande rigueur scientifique
- Excellente capacité d'organisation et gestion de son activité en autonomie
- Très bon esprit d'équipe, capacité à travailler de manière collaborative et à contribuer activement à la dynamique collective du laboratoire

Your Work Environment

L'IE rejoindra l'équipe « Bactéries Pathogènes et Phosphorylation des Protéines » au sein de l'unité MMSB (Molecular Microbiology and Structural Biochemistry), située sur le site Lyon Gerland et rattachée à l'IBCP. MMSB étudie, à l'échelle moléculaire et cellulaire, les mécanismes impliqués dans la pathogénie et la biologie des micro-organismes, en combinant des approches de microbiologie, d'imagerie cellulaire, de bio-informatique, de biologie structurale et de biochimie. L'IE travaillera au quotidien avec les différents membres de l'équipe en fonction des expériences réalisées. Son expertise lui permettra également d'interagir avec les personnels des autres équipes de l'unité. Le contrat est de 12 mois, avec possibilité de renouvellement jusqu'à deux fois.

Constraints and risks

Les contraintes sont inhérentes aux projets de recherche impliquant le travail sur le vivant. Les risques biologiques et chimiques sont ceux d’un laboratoire de recherche en sciences de la vie. La majorité des expériences sera réalisée en milieu de sécurité L1, mais il pourra être demandé à l’IE de travailler ponctuellement en milieu L2.

Compensation and benefits

Compensation

à partir de 2521 euros bruts mensuels selon expérience

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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