Missions

L’agent.e aura pour mission de contribuer à la modélisation computationnelle des maladies complexes, ainsi qu’au traitement bio-informatique et statistique de données omiques.
Le travail sera ciblé autour des objectifs du projet DIOGENES:
https://www.fc3r.com/approches-numeriques-3-2023.html

Activités

Activités principales (liste non limitative) :
• Développer des approches systémiques computationnelles pour la modélisation et la simulation de maladies complexes.
• Elaborer des pipelines bio-informatiques pour l’analyse et l’intégration de données omiques (données d’expression génique, données génomiques, métabolomiques, protéomiques).
• Favoriser le développement concerté d'outils et leur mise à disposition à l'ensemble du laboratoire.
• Mettre en place et maintenir des machines virtuelles sur le cloud/cluster pour le calcul scientifique.
• Participer à la rédaction de manuscrits scientifiques.

Activités associées/complémentaires :
• Organiser la veille scientifique et technologique.
• Former les membres du laboratoire aux principes et à la mise en œuvre d’outils développés en interne ou nouvellement utilisés par la communauté scientifique.
• Diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques et/ou de présentations orales.
• Encadrement d’étudiants en Licence et Master pour leur stage pratique et leur restitution écrite et orale.

Compétences

Connaissance, savoir :
• Connaissances théoriques générales dans le domaine des sciences de la vie (biologie intégrative, biologie cellulaire, biologie des systèmes).
• Connaissance pratique approfondie de logiciels appropriés aux analyses des données -omiques, des logiciels de l’analyse de réseaux et de modélisation computationnelle des maladies complexes.
• Connaissance théorique et pratique en programmation et statistique (langages R, python, bash).
• Connaissance de la déontologie, de l'éthique, de la loi et de la réglementation concernant le domaine de recherche (en particulier sur la confidentialité, sécurité informatique, sauvegarde et protection des données).

Savoir-faire :
• Motiver ses choix techniques auprès des responsables de projets.
• Travailler en interaction à la fois avec des biologistes expérimentaux, et des bio-informaticiens.
• Maîtriser les différents environnements OS, comme Mac, Windows, UNIX.
• Gérer les situations d'urgences et hiérarchiser les priorités.
• Maîtriser l'anglais à l'oral et à l'écrit.
Savoir être : Autonomie, capacité à travailler en équipe

Diplôme : Licence requise et Master souhaité

Qualification/Formation : Bio-informatique/Biologie computationnelle des systèmes

Contexte de travail

L'agent.e va travailler au Pole de Biologie des Systèmes sous la direction de la Professeure, Mme Anna Niarakis
https://cbi-toulouse.fr/fr/equipe-niarakis