Ingénieur Biologiste (H/F) en traitement de données

Job Description

Missions

Mettre en œuvre les analyses de Bioinformatique nécessaires à la réalisation du projet snoOPERA, incluant des analyses de données séquençage à haut débit de type CRAC, RNA-Seq et des analyses d’appariements ARN/ARN.

Activity

Activité 1 : Mise en œuvre d’analyses de Bioinformatique
o Analyse de données de CRAC en utilisant les pipelines bioinformatiques dédiés ;
o Recherche d’ARN hybrides ARNr-snoARN dans les données de CRAC ;
o Analyses de données de RNA-Seq en utilisant les pipelines disponibles sur la plateforme BigA ;
o Recherche de nouveau appariements ARNr-snoARN en utilisant le logiciel intaRNA ;
o Analyses phylogénétiques de conservation évolutive des snoARN.
Activité 2 : Téléversement des données de séquençage dans des bases de données
o Transfert des fichiers bruts et résultant des analyses bioinformatiques dans des bases de données type GEO en amont des publications;

Activité 3 : Production de figures pour la communication scientifique
o Utilisation du logiciel Adobe Illustrator ou équivallent pour générer des figures présentant les résultats des analyses de bioinformatique;
o Préparation de présentations de type Power-Point pour communications scientifique.

Activité 4 : Archivage des données de séquençage et des analyses de bioinformatique
o Sauvagarde des données brutes et analysées sur des disques de stockage externes et sur des serveurs distants dédiés (DROCC) ;

Your Profil

Skills

Savoirs / connaissances
o Maîtrise approfondie de diverses méthodes d’analyses en bioinformatique ;
o Maîtrise de l'anglais scientifique et technique écrit (B1), compréhension de l'anglais parlé ;

Savoir-faire
o Maîtrise des différents pipelines d’analyse des données de séquençage à haut débit (CRAC, RNA-Seq, etc…) ;
o Maîtrise des méthodes bioinformatiques de recherche de séquences hybrides dans les données de séquençage à haut débit ;

Savoirs-être
o Capacité à travailler en équipe
o Rigueur dans les analyses
o Capacité d’organisation du travail

Your Work Environment

Le poste d’Ingénieur-e d’étude est créé au sein de l’unité MCD du CBI dans l’équipe Henry-Henras. L’équipe vient d’obtenir un financement « ERC Synergy » pour un projet intitulé snoOPERA. Le projet nécessite une expertise en bioinformatique, qui n’est actuellement pas disponible dans l’équipe. L’encadrement de la personne recrutée sera effectué par Anthony Henras et Benjamin Albert. La personne recrutée sera amenée à interagir avec les personnels de la plateforme BigA de Bioinformatique du CBI.

Constraints and risks

Risque lié au travail sur écran (ergonomie...)

Compensation and benefits

Compensation

Entre 2496.98 € et 2662,14 € brut mensuel selon l'expérience

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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