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Portail > Offres > Offre UMR5075-JERGAU-010 - Chercheur postdoctoral en caractérisation structurale de la machinerie de biosynthèse de l'héparane sulfate (H/F)

Chercheur postdoctoral en caractérisation structurale de la machinerie de biosynthèse de l'héparane sulfate (H/F)

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : mercredi 30 juin 2021

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Informations générales

Référence : UMR5075-JERGAU-010
Lieu de travail : GRENOBLE
Date de publication : mercredi 9 juin 2021
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 septembre 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Selon expérience et à partir de 2648€ brut
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

Un poste de chercheur postdoctoral financé par ATIP-Avenir est ouvert dans notre nouvelle équipe au sein du groupe de recherché SAGAG de l'IBS à Grenoble.

Cette équipe dirigée par Rebekka Wild s'intéresse à la compréhension des mécanismes moléculaires des enzymes impliquées dans la biosynthèse de l'héparane sulfate. Les sulfates d'héparane sont de longues chaînes de polysaccharides très complexes trouvées à la surface des cellules et leur biosynthèse implique plus d'une douzaine d'enzymes membranaires localisées dans l'appareil de Golgi. Notre équipe combine des analyses biochimiques in vitro avec des approches de biologie structurale, en particulier la cryo-EM monoparticule, pour étudier les mécanismes moléculaires des enzymes de biosynthèse de l'héparane sulfate et leur assemblage en complexes macromoléculaires.

L'Institut de Biologie Structurale (IBS) est situé avec l'EMBL Grenoble, l'ILL et le Synchrotron de l'ESRF sur le campus de l'EPN et bénéficie d'excellentes infrastructures pour poursuivre des projets de biologie structurale ainsi que d'une communauté scientifique dynamique et pluridisciplinaire. L'équipe bénéficie d'un accès régulier à un TEM Glacios 200 kV et Titan Krios 300 kV pour le criblage et la collecte de données.

Nous recherchons un candidat très motivé avec un fort esprit d'équipe titulaire d'un doctorat en biologie structurale ou en biochimie des protéines. Une connaissance approfondie de l'expression et de la purification des protéines est attendue. De l'expérience antérieure avec la collecte, le traitement et la construction de modèles de données cryo-EM seraient des atouts. En outre, le candidat doit avoir d'excellentes compétences en communication écrite et orale en anglais et au moins une publication en tant que premier auteur.

Activités

1) Purification et caractérisation de protéines
- expression de protéines recombinantes dans des systèmes cellulaires mammifères
- purification de protéines solubles et membranaires
- tests d'activité enzymatique pour vérifier la fonctionnalité des protéines purifiées
- méthodes biophysiques pour étudier les interactions protéine-protéine & protéine-ligand

2) Détermination de structure
- préparation d'échantillons pour la collecte de données cryo-EM
- Criblage du réseau EM et collecte de données sur le MET interne 200kV Glacios
- traitement des données, interprétation et construction de modèles

3) Rédaction d'articles et présentation orale
- synthèse des résultats pour publication dans des revues à comité de lecture
- présentation des résultats lors de conférences nationales ou internationales

Compétences

1) Connaissances scientifiques
- Solide compréhension des mécanismes réactionnels enzymatiques et des relations structure-fonction des protéines
- Connaissance des différents types de glycosylation trouvés dans les cellules

2) Savoir-faire opérationnels
- Préparation des grilles cryo-EM, acquisition et traitement des données
- Purification des protéines par FPLC, avec différents types de colonnes de chromatographie
- Travail avec des cellules de mammifères dans des conditions stériles
- Caractérisation des échantillons par Western Blot, nanoDSF, SPR, ITC, MST,...

3) Compétences comportementales et relationnelles
- Être à l'aise dans un environnemment de travail constitué d'une petite équipe nouvellement constituée, avec des interractions directes et fréquentes
- Capacité à travailler en anglais (langue de travail de l'équipe) au quotidien : niveau B2 minimum requis (selon le Cadre européen commun de référence pour les langues).
- Capacité à travailler efficacement avec d'autres membres du laboratoire et collaborateurs sur un projet
- Capacité à établir de nouveaux flux de travail
- Personnalité créative et orientée solution
- Rigueur technique et bon sens de l'organisation

Contexte de travail

L'IBS est une unité mixte de recherche CEA-CNRS-UGA d'environ personnes située dans l'environnement scientifique de la presqu'île scientifique à Grenoble, qui accueille les unités CEA et CNRS, ainsi que les laboratoires européens de l'ILL, de l'ESRF et de l'EMBL, créant une synergie locale dynamique au travers de partenariats forts (Partenariat pour la Biologie Structurale - PSB).

Le groupe SAGAG (Groupe Structure et Activité des Glycosaminoglycanes) est composé de trois équipes et dispose d'une expertise historique et internationalement reconnue dans la caractérisation des structures d'héparane sulfate et de leur interaction avec les protéines. La nouvelle équipe Wild se concentre sur la caractérisation fonctionnelle et structurelle des enzymes impliquées dans la biosynthèse de l'héparane sulfate et le candidat postdoctoral devra travailler en étroite collaboration avec les autres membres du groupe pour faire avancer et mener à bien les projets en cours.

L'équipe a un accès direct à plusieurs plates-formes et installations de pointe, notamment une installation de microscopie électronique bien équipée, la cristallisation des protéines, la spectrométrie de masse et plusieurs instruments pour la caractérisation biophysique des protéines.

Lien de l'équipe :
https://www.ibs.fr/research/research-groups/structure-and-activity-of-glycosaminoglycans-group/atip-junior-team-r-wild/

Contraintes et risques

néant

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