Missions

Nous recherchons un(e) ingénieur(e) d’étude spécialisé(e) en métabolomique, avec une expertise en spectrométrie de masse (SM), pour contribuer à l’étude des mécanismes métaboliques des organoïdes de tissu adipeux beige à différents stades de leur développement, en utilisant des techniques avancées d'analyse biochimique. Sa mission principale consistera à établir une cartographie métabolique des organoïdes de tissu adipeux beige humain afin d’optimiser leur développement et d'acquérir une compréhension approfondie des mécanismes d'adaptation métabolique qui se produisent tout au long de leur développement in vitro. Dans ce cadre, l’ingénieur(e) contribuera à l’identification des nutriments utilisés à différentes étapes de développement, en caractérisant l’exométabolome et l’endométabolome. Il/elle participera également à des études sur la dynamique métabolique par la réalisation d’expériences de traçage isotopique (isotope stables marqués au carbone C13) et effectuera une analyse détaillée de l'incorporation de carbone C13 dans les métabolites via la SM.

Activités

Activités principales :
La personne recrutée sera en charge de 1) participer à la collecte, au suivi et à la préparation des échantillons, ainsi qu’à l’extraction des métabolites, 2) réaliser des analyses à l’aide des techniques analytiques avancées, telles que la chromatographie liquide à haute performance (HPLC) et la spectrométrie de masse à haute résolution (HR-MS), en complément d’autres méthodes de bioanalyse, 3) mettre au point les outils nécessaires pour le traitement des données générées, 4) effectuer des analyses biostatistiques, synthétiser les résultats, et les présenter lors des réunions hebdomadaires et des réunions d’équipe.

Activités associées :
- Travail en collaboration entre 2 équipes de l’Institut RESTORE (EQ3 et EQ4) et en interaction avec les autres partenaires du projet (Equipe Elia, LAAS), ainsi qu’avec la plateforme MetaToul,
- Gestion et organisation des moyens techniques dans le cadre de l’étude, incluant la gestion des matériels et consommables, entretien et maintenance des équipements, formation des utilisateurs aux techniques développées, commandes, etc.,
- Rédaction de rapports d’expérience ou d’étude, de notes techniques, de protocoles de laboratoires, participation à la rédaction de publications,
- Communication (interne et externe) sur les données expérimentales,
- Participation au fonctionnement collectif de l’équipe et du laboratoire (gestion des stocks de consommables, participation au suivi des équipements, participation aux réunions d’équipe, taches collectives).

Compétences

- Solides connaissances scientifiques en biochimie et chimie analytique,
- Solide expertise dans l’utilisation de techniques analytiques séparatives, telles que la HPLC et la HRMS ; une connaissance d’autres techniques analytiques, telles que l’imagerie par spectrométrie de masse (MSI) et la résonance magnétique nucléaire (RMN), serait un atout,
- Expérience en métabolomique analytique, incluant la préparation des échantillons, l'acquisition et l'analyse des données ; des compétences en fluxomique seraient un atout,
- Capacité à développer des protocoles analytiques en métabolomique,
- Notions en mathématiques, méthodes statistiques et programmation informatique (R ou Python),
- Capacité à travailler en équipe ; une expérience en gestion de projet serait appréciée,
- Connaissance des règles d’hygiène et de sécurité pour le travail en milieu confiné ou protégé, notamment lors de la manipulation de produits chimiques et de risques biologiques,
- Excellente communication, rédaction, transmission de savoir-faire technique, rigueur, organisation et autonomie,
- Anglais : compréhension orale (niveau I), compréhension écrite (niveau II).

Contexte de travail

Ce poste s’inscrit dans le cadre du projet MetaOrgan, qui vise à contrôler le métabolisme pour générer un organoïde de tissu adipeux beige humain standardisé et fonctionnel. Ce projet, financé par l'ANR, est mené au sein de l’institut RESTORE. La personne recrutée fera partie de l’EQ3 ("Metabolic interplay and age-associated loss of function").

Contraintes et risques

La personne peut être amenée à se déplacer dans plusieurs instituts ou laboratoires, tels que les sites RESTORE (Campus Oncopole et Faculté de chirurgie Dentaire à Rangueil) ainsi que ceux de la plateforme MetaToul, pour assister à des formations, acquérir de nouvelles techniques et compétences, ou réaliser des expériences sur différentes technologies.

Informations complémentaires

Les candidats doivent envoyer une lettre de motivation, ainsi qu'un CV détaillé contenant la description de leurs activités de recherche précédentes et le nom et les coordonnées de 2 référents (2 pages maximum).