Missions

Nous recherchons un candidat ou une candidate très motivé pour pourvoir un poste de chercheur financé par l’ANR afin d'appliquer notre méthode d’ARN-FISH séquentielle à notre modèle d'étude.

Activités

Le candidat ou la candidate sera chargé de :
- la conception et l’amplification des bibliothèques de sondes FISH,
- la croissance de colonies bactériennes,
- l’utilisation de la méthode ARN-FISH, et
- l’acquisition et analyse de données d'imagerie multiplexée.

Compétences

Le candidat ou la candidate aura une expertise en biologie moléculaire et/ou microscopie.
Il ou elle manifestera un fort intérêt à travailler à l'interface entre la biologie, la bio-informatique et la physique.

Contexte de travail

Le Centre de biologie structurale (CBS) mène des recherches à la pointe de la biologie structurale et de la biophysique afin de révéler les mécanismes physiques fondamentaux de l'activité biologique et de sa régulation. Le CBS est situé au cœur d'un campus de recherche de calibre mondial en biologie dans la ville dynamique de Montpellier sur la Côte méditerranéenne. Il héberge des groupes de recherche ayant une expertise dans de nombreuses microscopies avancées, y compris la microscopie multiplexée, à haut débit, la microscopie de super-résolution de la molécule unique (PALM/STORM), ou encore la microscopie à illumination structurée 3D, les spectroscopies de corrélation de fluorescence, les pinces magnétiques et optiques, la microscopie à force atomique à grande vitesse et la cryo-microscopie électronique.

Notre groupe interdisciplinaire s'intéresse à la compréhension des mécanismes d’organisation et du remodelage de l’ADN dans les organismes multicellulaires, y compris les biofilms bactériens. Le projet actuel s'inscrit dans le cadre d'une collaboration de longue date avec le groupe de Tâm Mignot au LCB (CNRS, Marseille) et porte sur l'étude de la motilité et des mécanismes prédateurs de la bactérie du sol Myxococcus xanthus. Étant donné que le programme de transcription des bactéries individuelles est très hétérogène au cours du développement du biofilm, les technologies traditionnelles de séquençage sont mal adaptées pour décortiquer le programme de différenciation des sous-populations de cellules. Pour contourner cette limitation, notre laboratoire a récemment développé une version séquentielle d’ARN FISH pour détecter des gènes d'ARN dans des cellules individuelles in situ sans perturber l'organisation spatiale de la colonie bactérienne.

Pour plus d’informations, veuillez visiter notre site internet: http://nollmannlab.org/

Pulications pertinentes:
Rombouts et al, Nature Communications 2023, 14:5588 .
Espinola, Goetz, et al. Nature Genetics, 2021, 53, pages 477-486.
Guilhas, et al. Mol Cell, 2020 Jul 16;79(2):293-303.e4.
Cardozo Gizzi, et al., Mol Cell, 2019, 74, Issue 1, p1-222.
Faure, Fiche et al., Nature, 2016, 539(7630):530-535.
Marbouty, Le Gall, et al. Mol Cell, 2015, 59 (4): 588-602.

Contraintes et risques

Les candidats ou candidates intéressés doivent déposer leur CV avec références

Contrat initial d’un an, renouvelable.