Missions

• Simulation de structures de protéines membranaires par dynamique moléculaire
• Caractérisation des changements conformationnels des protéines transmembranaires associés à la liaison de ligands et à l'activation/désactivation.
• Criblage virtuel de nouveaux ligands et optimisation basée sur la structure

Activités

• Simulations moléculaires de protéines transmembranaires et interactions avec des ligands et des partenaires fonctionnels
• Analyses de la dynamique conformationnelle des protéines et des interactions avec les ligands/partenaires fonctionnels, en comparaison avec les données biophysiques/pharmacologiques
• Etudes des mécanismes d'action des ligands/mutations/partenaires fonctionnels
• Criblage, conception et optimisation de ligands in silico
• Mesures biophysiques des changements conformationnels des protéines et des interactions avec les ligands/partenaires

Compétences

Un Doctorat avec une expérience Post-doctorale de plus de 2 ans, en simulation dynamique de protéines membranaires est demandé.
• Savoirs / connaissances : Simulations de dynamique moléculaire à échantillonnage amélioré de protéines transmembranaires
• Savoir-faire: Programmation en R et/ou Python
• Savoir-être : Communications et de présentations interdisciplinaires

Contexte de travail

La biologie structurale et la pharmacologie des protéines transmembranaires en tant que cibles (potentielles) de médicaments, en combinant des approches biophysiques et la modélisation moléculaire. Le projet est financé par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR).

Contraintes et risques

Le candidat ou la candidate sera principalement affecté à l’Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF) et travaillera en collaboration étroite avec le Centre de Biologie Structurale (CBS). Les 2 laboratoires sont à proximité l’un de l’autre.