Missions

Développement (design, construction et caractérisation) des souches d'Escherichia coli. Le génotype et les plasmides incorporés seront définis en fonction de mesures biophysiques. Les souches construites devront ensuite être caractérisées par la mesure de la croissance et de l'expression génique.

Activités

Modification du génome d'E.Coli, conception et réalisation de variantes des souches et caractérisations phénotypiques.

Activités principales.
- Optimisation de l'expression de plasmides, production de protéines, croissance cellulaire, émission de fluorescence.
- Conception, construction, séquençage et transformation de plasmides, conception d'amorces (primers) d'ADN.

Activités secondaires :
- Études phénotypiques des souches générées par mesures biophysiques basées sur la microscopie optique.
- Revue de la littérature pour orienter la construction des souches bactériennes.
- Participation à l'activité de l'équipe.
- Développement de nouvelles procédures et méthodes analytiques.
- Traitement des résultats analytiques bruts, interprétation et présentation des résultats.
- Rédaction des rapports scientifiques périodiques sur l'avancement du projet.

Compétences

- Expérience en biologie moléculaire, ou biologie synthétique, ou ingénierie génétique en microbiologie (E. coli ou autres bactéries)
- Expérience pratique dans les méthodologies standards de biologie moléculaire : culture cellulaire, isolement cellulaire, techniques stériles de base, cartographie de l'ADN, clonage de l'ADN, extraction de l'ADN, séquençage de l'ADN, transformation bactérienne, conception et construction d'amorces et de vecteurs, Western blot, PCR, électrophorèse sur gel, minipreps
- Expérience dans la manipulation des bactéries pathogènes en laboratoire de type LSB2 (compétence souhaitée)
- Programmation en Python (compétence souhaitée)
- Intérêt pour le travail dans un contexte pluridisciplinaire, à l'interface entre biologique et physique
- Capacité à interagir, communiquer et s'intégrer dans une équipe avec des expériences diverses
- Capacité à penser de manière critique et créative
- Compétences linguistiques : anglais écrit et oral souhaité

Contexte de travail

Le candidat ou la candidate sera affecté pour l'ensemble de son activité à l'équipe « Physique et mécanique des systèmes biologiques » du Centre de Biologie Structurale à Montpellier (France), dans le cadre d'un projet ANR.

Contrat initial de 6 mois, renouvelable.

Contraintes et risques

La manipulation des bactéries pathogènes de classe II (compétence souhaitée mais pas obligatoire) nécessitera de travailler dans des laboratoires LSB2 où il sera requis d'appliquer les règles d'hygiène et de sécurité.