Missions

L'ingénieur d'études en conception et diffusion de ressources pédagogiques pour la gestion et l'analyse des données de microbiomes et de santé aura pour mission de construire et diffuser, en lien avec les partenaires du projet Cloud4Sams et l'équipe formation de l'IFB, les ressources prédagogiques du projet.

Activités

o Concevoir et diffuser des ressources pédagogiques (tutoriels, jeux de données, exercices pratiques, hackathons) visant à transmettre les bonnes pratiques de gestion, analyse et valorisation des données du microbiome humain, dans le respect des différents cadres (techniques, juridiques, sécurité, métadonnées), en partenariat avec les experts du projet Cloud4sams. Assurer le respect des principes FAIR des ressources développées.
o Organiser des événements (webinaires, hackathon, formations sur site) visant à favoriser l’utilisation de ces ressources par les communautés cibles
o Assurer la diffusion des matériels de formation dans les catalogues nationaux et internationaux
o Participer aux réunions du projet Cloud4sams et des communautés Santé et Microbiologie de l’IFB.
o Participer aux réunions du groupe de travail et de l’équipe formation de l’IFB (en présence et/ou vidéoconférence) ainsi que de la plateforme Migale
o Participer aux actions de formation de l’IFB au niveau national.
o Coordonner fonctionnellement un projet(s) impliquant 5 à 10 personnes
o Etre le tuteur de 1 ou 2 apprenti(s) ou stagiaire(s)

Compétences

 Savoirs / connaissances Génomique, Microbiologie, Bioinformatique, Gestion de données (principes FAIR,...).
 Savoir-faire Usage d'environnements d'analyse bioinformatique type cloud, connaissance des outils de gestion collaborative (git, moodle). Expérience ou motivation pour la formation et la pédagogie
 Savoirs-être Capacité de travail collaboratif et à distance

Contexte de travail

La personne recrutée travaillera au sein de la plateforme MIGALE de l'unité MaIAGE au centre INRAE de Jouy-en-Josas.
- Possibilité de faire du télétravail
- Temps de travail: 38h30/semaine et 45 jours de congés annuels
- Le travail nécessitera des déplacements occasionnels pour participer à des réunions, des formations ou des événements.

Le projet Cloud4sams vise à construire une infrastructure numérique
distribuée et sécurisée permettant aux scientifiques d’exploiter des données de microbiomes et de santé. L’équipe formation de l’IFB est chargée du WP formation/dissémination.
L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) est une infrastructure nationale en biologie-santé regroupant 28 plateformes régionales de bioinformatique et une unité coordinatrice, IFB-core (UAR 3601). L’IFB a pour mission de mettre en place un service national en bioinformatique, accessible à tous les chercheurs en sciences du vivant, sous la forme d’une infrastructure environnée (stockage, calcul, environnement logiciel, bases de données, serveurs web nationaux, support aux usagers, accompagnement de projets, formations, …), de répondre à l’évolution rapide des technologies et des besoins, et d’anticiper les futurs développements du domaine.