Missions

Conduire et développer des approches méthodologiques dans les domaines de l’histologie et de la biologie spatiale.

Activités

◦ Conduire dans un cadre expérimental, un ensemble de techniques en histologie (préparation et coupe de cryoblocs, colorations, immunohistochimie, immunofluorescence, transparisation des tissus, préparation à la numérisation)
◦ Former les utilisateurs au fonctionnement des appareillages présents sur le plateau et aux bonnes pratiques en histologie
◦ Conseiller et assister les utilisateurs de la plateforme dans la construction et la réalisation de leurs projets
◦ Participer à la gestion des moyens matériels, techniques et financiers alloués (stocks, entretien des locaux, achats, devis aux utilisateurs)
◦ Contribuer à la démarche qualité mise en place
◦ Assurer l'application des principes et des règles d'hygiène et de sécurité́
◦ Participer aux activités de prestations de services des plateaux (coupes à façon, expériences d’hybridation, colorations, immunomarquages, etc.)
◦ Rédiger des rapports d'expériences ou d'études, des notes techniques et assurer le suivi de la traçabilité des échantillons traités et des actes techniques réalisés
◦ Préparer et assurer le suivi des appareillages communs (cryostat, microtome, imprimante de casettes, flashfreeze, etc.) et en assurer la maintenance de premier niveau.
◦ Implémenter de nouvelles approches en lien avec le développement des plateaux : mise au point de coloration/marquages spécifiques et développement de la biologie spatiale
◦ Suivre les évolutions techniques et le développement dans le domaine de l’histologie, impliquant la mise en place et la validation de nouveaux protocoles ou de nouvelles ressources biologiques selon les besoins des utilisateurs
◦ Assurer une veille technologique et scientifique en lien avec les questions de biologie spatiale

Compétences

Compétences techniques
◦ Mise en œuvre des techniques d'histologie (vibratomie, cryotomie), Immunohistochimie, hybridation in-situ (RNAscope)
◦ Connaissances de base en microscopie (fluorescence, bright-field)
◦ Compétences en gestion et analyse d'images microscopiques pour la R&D
◦ Connaissances en bioinformatique de base ; capacité à utiliser ou adapter des pipelines de traitement ; Notions de programmation (R ou Python) pour explorer, visualiser et analyser les données.
◦ Compréhension de l'analyse spatiale ; Connaissances de base en analyses multivariées (PCA, Heatmap).
◦ Travailler en démarche qualité
Compétences transversales
◦ Rigueur, curiosité scientifique et sens critique
◦ Autonomie dans la gestion de projets techniques
◦ Capacité à hiérarchiser ses tâches et organiser son activité en tenant compte des échéances
◦ Aptitude au travail en équipe
◦ Bon relationnel (contact avec de nombreux utilisateurs)
◦ Capacité à travailler en interface avec des biologistes, bioinformaticiens et ingénieurs en imagerie
◦ Sens du service
◦ Compétences en rédaction de rapports
Autres compétences appréciées
◦ Connaissances en IA/apprentissage automatique appliquées à l'image ou aux données biologiques.
◦ Participation à la mise en place de procédures/protocoles reproductibles

• Solides bases en biologie cellulaire et moléculaire
• Une expérience du travail en plateforme serait un plus
• Connaissances en imagerie et analyse d'images serait un plus
• Maîtrise de l'anglais scientifique, à l'oral et à l'écrit

Contexte de travail

Le Réseau d'Histologie Expérimental de Montpellier (RHEM) est une plateforme technologique faisant partie de l'Unité de Service Biocampus Montpellier. Il regroupe trois plateaux localisés chacun dans des instituts de recherche montpellierains dont les compétences et activités proposées aux utilisateurs du réseau sont complémentaires.

Dans le cadre de l'obtention d'un financement du Pôle Universitaire d'Innovation, les plateaux AdV et IGMM du RHEM, souhaite recruter un ingénieur(e) pour leur permettre de répondre aux demandes croissantes de prestations en cryotomie et de développer les approches de biologie spatiale. Le candidat ou la candidate sera affecté(e) aux plateaux d'Histologie de AdV (60% du temps) et de l'IGMM (40% du temps) sous la supervision des responsables techniques de chaque plateau. Il/elle développera et mettra en œuvre de nouvelles techniques d'analyses tissulaires et de biologie spatiale de manière à répondre aux besoins et questions biologiques des utilisateurs de ces plateaux

• Lieu de travail : Institut de Génomique Fonctionnelle (60% du temps) & Institut de Génétique Moléculaire ; Montpellier (40% du temps) ; France
• Avantages : Restauration collective ; Comité d'Action Social du CNRS

Contraintes et risques

◦ Manipulation de produits chimiques CMR
◦ Manipulation de matériels biologiques fixés ou non
◦ Travail en confinement L2 pour les échantillons humains et/ou Prion-like
◦ Utilisation d’équipement de microtomie (risque de coupure) et d’imagerie