Missions

L'agent sera responsable de la purification et de la caractérisation des protéines recombinantes produites après infection de cellules d'insectes par des baculovirus recombinants. Il/elle participera également à la production des protéines recombinantes. Il/elle travaillera en collaboration étroite avec les agents qui sont en charge de la construction des virus et de la production des protéines. L’agent prendra également en charge différents projets R&D permettant d’améliorer l’offre de services de la plateforme.

Activités

1. Conduire, en adaptant les conditions expérimentales, un ensemble de techniques pour la purification et la caractérisation de protéines à usage thérapeutique :
• Optimiser la purification des anticorps ou des molécules dérivées d'anticorps sur colonne d'affinité telles que protéine A, protéine G, protéine L, Kappa ou Lambda Select
• Développer la purification des protéines ou glycoprotéines étiquetées (tag 6-His, StrepTag, tag GST, …)
• Analyser les protéines par HPLC, électrophorèse en gel de polyacrylamide et Western blot
• Quantifier les protéines par Absorbance UV, ELISA ou dosage enzymatique
• Entretenir et contrôler les matériels utilisés pour la purification et l'analyse des protéines
2. Prendre en charge un projet de recherche et développement :
• Etablir les stratégies de construction de virus recombinants en fonction des caractéristiques et/ou des contraintes du projet.
• Construire les baculovirus multi-recombinants, les cloner et caractériser leur génome
• Mettre en place le procédé de purification en fonction des caractéristiques de la protéine d'intérêt
• Choisir et adapter les technologies d'analyse et d'expérimentation en fonction du projet
• Réaliser les expériences dans les délais impartis
• Exposer les résultats au cours des réunions de laboratoire et des réunions d'avancement de projet
• Assurer la veille scientifique et technologique liée au projet
3. Participer à la production des protéines et à la mise au point de nouveaux systèmes de culture :
• Entretenir des cellules d'insecte en boite, en erlenmeyer, en cytoculteur
• Produire des protéines recombinantes en roller, en cytoculteur
• Gérer des banques de cellules
• Amplifier des baculovirus recombinants pour la production de protéines
4. Rédiger ou analyser des documents afférents :
• Rédiger un cahier de laboratoire numéroté
• Rédiger les résultats dans les rapports de fin de contrats
• Rédiger les protocoles techniques et les formulaires d'enregistrement des résultats
• Mettre à jour toute la documentation liée à l'utilisation et à la conservation des différents supports chromatographiques
• Rédiger les protocoles techniques dans le cadre du management de la qualité
• Lire et comprendre des instructions en anglais
• Présenter oralement les résultats au cours des réunions de travail de l'unité ou de congrès
5. Participer à l'organisation de la plateforme :
• Participer au management de la Qualité selon la norme NFX50-900
• Assurer la gestion des stocks et des commandes des consommables
• Proposer des pistes d'amélioration du fonctionnement général

Compétences

1. Connaissances :
• Connaissances générales en chimie, en biochimie, en biologie cellulaire, en virologie et en biologie moléculaire
• Connaissances des principes de la purification des protéines étiquetées ou non
• Langue anglaise : B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)
• Connaissance de la réglementation en matière d'hygiène et de sécurité
• Notions de management de la qualité norme ISO 9001
2. Compétences opérationnelles/Savoir-Faire :
Les techniques suivantes devront être maitrisées :
• La purification des protéines recombinantes : Chromatographie d’affinité, exclusion de taille, HPLC, préparation des tampons, …
• La culture cellulaire : en particulier la culture des cellules d’insectes.
• L’analyse des protéines : électrophorèse en gel de polyacrylamide, Western blot, ELISA.
• La biologie moléculaire : le clonage de gènes, la PCR, l’extraction d’acides nucléiques à partir de bactéries, et de virus. L’hybridation moléculaire ADN/ADN et toutes les techniques annexes, préparation de sondes, synthèse de gène, …
• La virologie : multiplication du baculovirus, titrage de suspensions virales. Construction de baculovirus mono- et multi-recombinants : génération des virus, purification des virus, caractérisation des génomes viraux.
En informatique :
• Savoir utiliser un traitement de texte (Exemple : Word), les logiciels d’analyse de séquences (Exemple : Serial Cloner), les logiciels d’alignement de séquences (Exemples : Multalin, Clustal).
• Savoir réaliser une recherche bibliographique sur PUBMED.
• Savoir trouver une séquence de gène dans GenBank.
• Savoir analyser les séquences de protéines.
Savoir-faire général :
• Transmettre ses connaissances théoriques et son savoir-faire (encadrement de stagiaires)
3. Aptitudes :
• Capacité de raisonnement analytique
• Sens de l'organisation
• Autonomie
• Rigueur/fiabilité
• Sens relationnel

Contexte de travail

BioCampus Montpellier - CNRS UAR3426 - INSERM US09 - UM regroupe 18 plateformes technologiques réparties en 70 plateaux techniques au sein des laboratoires de recherche des Pôles Biologie-Santé et Agronomie/Environnement/Biodiversité de Montpellier et ses environs. Plus de 280 agents, affectés ou non à l'UAR, travaillent sur ces plateformes.
La plateforme BACFLY est située à Saint-Christol-lèz-Alès à environ 70 km au nord de Montpellier. Ses missions sont d'une part la Recherche et Développement sur le système baculovirus et sa cellule hôte, la cellule de lépidoptères (développement d'outils originaux spécifiques), d'autre part l'application de ces outils à la production de protéines recombinantes à usage thérapeutique (anticorps et molécules dérivées d'anticorps, protéines complexes, Virus-LikeParticles VLP, …). L’équipe fait partie du laboratoire d'excellence (LabEx) MabImprove. Elle est composée de 6 agents. Les activités sont réparties en 3 sous-groupes selon les thématiques suivantes (i) optimisation des modifications post-traductionnelles et vaccins protéiques (ii) anticorps mono- et bispécifiques (iii) production / purification des protéines recombinantes. L’ingénieur-e sera intégré(e) dans ce dernier sous-groupe. L'activité de la plateforme est organisée en mode projet, tous les agents sont ainsi responsables et/ou collaborateurs d'un projet avec un autre ITA, le responsable de la plateforme supervisant tous les projets. Le fonctionnement de la plateforme s’inscrit dans un cadre de prestation de recherche ou de collaborations scientifiques. Les activités de R&D sont fortement valorisées (publications & brevets) et s’inscrivent régulièrement dans des contrats de collaboration de recherche avec des groupes de recherche nationaux et internationaux ou des entreprises.

Contraintes et risques

Travail en laboratoire de biologie (L1)