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Portail > Offres > Offre UAR3278-NATTOL-009 - Post-Doc H/F Biodiversité de l'holobion corallien face au stress local (turbidité) et global (coral bealching)

Post-Doc H/F Biodiversité de l'holobion corallien face au stress local (turbidité) et global (coral bealching)

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : vendredi 9 décembre 2022

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Informations générales

Référence : UAR3278-NATTOL-009
Lieu de travail : PERPIGNAN
Date de publication : vendredi 18 novembre 2022
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 février 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2 800 et 4 000€ bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

Compte tenu de la transformation réelle des récifs coralliens, l'augmentation de la turbidité dans l'écosystème côtier résultant de la déforestation et le blanchissement des coraux dû à l'augmentation de la température de l'eau océanique et corallienne sont les facteurs de stress les plus frappants et les moteurs des transformations réelles des récifs coralliens.
Le projet s'appuiera sur le programme Tara Pacific en analysant les données de Tara Pacific en relation avec les deux facteurs de stress mentionnés ci-dessus, en ajoutant un échantillonnage dans l'océan Indien et dans les Caraïbes et en entreprenant une analyse contrôlée in situ en relation avec turbidité et blanchissement corallien.
Ces tâches seront entreprises sur la base des approches métagénomiques et métatranscriptomiques déjà développées dans l'analyse de Tara Pacific pour assurer la continuité et le parallèle dans l'analyse

Activités

- Analyse des données métagénomiques et métatranscriptomiques des holobiontes coralliens de l'échantillonnage de Tara Pacific dans le contexte de l'événement historique de blanchissement des coraux en récupérant l'événement de blanchissement autour de chaque zone d'échantillonnage
- Analyse métagénomique et métatranscriptomique des holobiontes coralliens issus de l'échantillonnage de Tara Pacific dans le contexte de la turbidité qui sera corrélée à l'île de masse continentale à proximité des zones d'échantillonnage
- Collections d'échantillons Océan Indien et Caraïbes
- Stress de turbidité expérimental in situ et collecte de colonies coralliennes pour analyse métagénomique et métatranscriptomique
- Stress de blanchissement expérimental in situ et collecte de colonies coralliennes pour analyse métagénomique et métatranscriptomique

Compétences

• Analyse des données métagénomiques et métatranscriptomiques des holobiontes coralliens
• Développement de pipelines métagénomiques et métatranscriptomiques pour décrire l'assemblage de données sur la diversité des protistes, des virus et des bactéries dans l'holobionte corallien
• Expérience in situ et in vivo pour tester expérimentalement
• Collections d'eaux coralliennes et environnementales
• Analyse de la turbidité contrôlée sur l'holobionte corallien
• Analyse du blanchissement contrôlé sur l'holobionte corallien

Contexte de travail

Même s'ils ne couvrent que ~0,2% de la surface de l'océan, les récifs coralliens abritent ~30% de la biodiversité des océans, fournissant des services écologiques (pêche, tourisme, protection des côtes), à près d'un milliard de personnes et estimés à 30 milliards USD par an. Le XXe siècle a vu la Terre entrer dans ce que l'on appelle aujourd'hui l'Anthropocène. Des changements d'origine anthropique se produisent à l'échelle mondiale et locale et altèrent la physiologie des organismes et des écosystèmes en modifiant les processus physiques, chimiques et biologiques de la Terre. Parmi les écosystèmes marins, les récifs coralliens ont le malheureux privilège d'être très sensibles à ces modifications environnementales. En particulier, le processus thermique de blanchiment des coraux, c'est-à-dire la perte des endosymbiontes microalgaux photosynthétiques obligatoires, décime de plus en plus les coraux. Les projections estiment qu'environ 25 % des récifs ont déjà été perdus et que jusqu'à 99 % seront menacés et radicalement transformés d'ici 2050.
L'expédition Tara Pacific a duré plus de deux ans (2016-2018), appliquant les technologies les plus récentes pour cartographier la complexité «-omique» de l'holobionte corallien au sein de son écosystème et à travers tout l'océan Pacifique. Considérant qu'une approche holistique qui intègre toutes les composantes du biote récifal est irréaliste, l'expédition Tara Pacific concentre son approche sur les holobiontes coralliens et poissons largement distribués et leur environnement biologique (plancton) et physico-chimique contextuel.

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