Chargé de l'analyse bio-informatique des données de génome de microorganismes (H/F)
New
- IT in FTC
- 5 month
- BAC+5
This offer is open to people with a document recognizing their status as a disabled worker.
Offer at a glance
The Unit
Centre de recherche en écologie expérimentale et prédictive - Ecotron Ile-de-France
Contract Type
IT in FTC
Working hHours
Full Time
Workplace
35000 RENNES
Contract Duration
5 month
Date of Hire
01/10/2026
Remuneration
A partir de 3143.64 € bruts par mois selon votre expèrience
Apply Application Deadline : 16 July 2026 23:59
Job Description
Missions
Au sein de du projet européen Microbes4Climate (M4C) impliquant le CEREEP-Ecotron IdF et ECOBIO. ,vous serez chargé de l’analyse bio-informatique des données de génome de microorganismes produites à partir de cellules uniques pour l’étude des conséquences de stress environnementaux extrêmes sur les microorganismes du sol, une expérimentation réalisée par le CEREEP Ecotron IdF.
Activity
En tant que Ingénieur de recherche , vos activités sont les suivantes :
• mobiliser un workflow existant préalablement développé pour l’analyse des génomes produits par approche single-cell
• compléter/adapter les développements du workflow existant
• produire des analyses de phylogénomique et de génomique des populations à partir des données mscWGS
• interpréter les données
Your Profil
Skills
Diplômé en génomique microbienne, vous avez une excellente connaissance de l’analyse bio-informatique de données de séquençage WGS à partir de cellules uniques et une expertise dans l’interprétation des variants génomiques (génomique comparative)
Vous savez travailler de manière autonome et avez une capacité d’écoute pour adapter les analyses aux questions de recherche.
Vous maîtrisez les techniques de calcul de scientifique appliquées à la biologie, et êtes microbiologiste de formation initiale.
Vous faites preuve d’ initiative et d’imagination.
Vous êtes reconnu pour vos compétences en bio-informatique et en génomique microbienne.
Your Work Environment
L’UMR ECOBIO est une unité de recherche du domaine de l’écologie collaborant avec l'UAR 3194 CEREEP-ECOTRON IdF dans le cadre d’un projet Européen Microbes4Climate et qui dispose de compétences dans le domaine de l’analyse de données génomique bactérienne produites par approche single cell.
Le travail s’effectuera en lien étroit entre les 2 structures
Constraints and risks
Déplacement à prévoir entre Rennes (35) et Saint-Pierre-Lès-Nemours (77).
Compensation and benefits
Compensation
A partir de 3143.64 € bruts par mois selon votre expèrience
Annual leave and RTT
44 jours
Remote Working practice and compensation
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
About the offer
| Offer reference | UAR3194-SOPVAZ-033 |
|---|---|
| Line of business | Life, Earth and Environmental Sciences |
| Job Type | Biological Data Analysis Engineer |
| Relevant experience | 1 to 4 years |
About the CNRS
The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.
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