Missions

Choisir, concevoir, adapter et/ou mettre en œuvre les méthodes et outils statistiques et informatiques nécessaires au traitement de données issues des sciences du vivant.

Activités

- Concevoir et réaliser des développements bio-informatiques et/ou bio-statistiques (principal)
- Concevoir, mettre en œuvre, adapter et/ou optimiser les procédures de traitement des données en biologie et santé (principal)
- Choisir et mettre en œuvre des méthodes et outils adaptés pour répondre à une question biologique (principal)
- Assurer le bon fonctionnement et l'évolution des applications bio-informatiques et/ou bio-statistiques (principal)
- Assurer et organiser une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité́ et dans un contexte interdisciplinaire (principal)

- Diffuser et valoriser les résultats et les développements sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales, formations (secondaire)
- Conseiller et former aux techniques et outils développés (secondaire)
- Participer aux activités internes de la plateforme (groupe de travail, animation technique)
- Participer à des réseaux professionnels (secondaire)

Compétences

Connaissances
- Expertise des logiciels implémentant les méthodes et algorithmes pour l'analyse de données en biologie et santé
- Maîtrise d'au moins deux langages de programmation et/ou de script
- Connaissances en gestionnaires de workflow et environnements de calcul haute-performance
- Connaissances des statistiques et des logiciels/langages associés pour l'analyse et la visualisation des résultats
- Notions avancées de biologie (biologie moléculaire et cellulaire, génomique et génétique), des technologies de production des données et des bases de données de référence
- Langue anglaise : B1 à B2

Savoir-faire opérationnel
- Interagir avec des experts de divers domaines appliqués dans un contexte interdisciplinaire
- Garantir la pertinence des outils mis en oeuvre et la qualité des résultats obtenus
- Garantir la reproductibilité des analyses et/ou mettre en œuvre une démarche qualité
- Savoir interpréter et critiquer les résultats d'une analyse de données
- Avoir le sens de l'organisation : gestion du temps et des priorités
- Communiquer : présentations orales, rédaction de rapports, d'articles et de documentations
- Assurer une veille technologique

Compétences comportementales
- Capacité à travailler en équipe et à l'interface entre plusieurs disciplines
- Autonomie et sens de l'initiative
- Faculté d'adaptation et sens de l'organisation
- Rigueur et fiabilité

Contexte de travail

L'ingénieur.e d'étude exercera ses fonctions sur la plateforme de bioinformatique Bilille, au sein de l'UAR 2014 Plateformes Lilloises en Biologie et Santé (PLBS). L'unité PLBS regroupe 8 plateformes scientifiques et technologiques au service des 24 unités de recherche académiques en sciences de la vie et de la santé sur la métropole lilloise. En tant que plateforme labellisée par le GIS IBiSA, Bilille peut également être sollicitée par la communauté de recherche publique ou privée au-delà de la métropole lilloise. PLBS compte 95 personnels ingénieurs et techniciens présents sur 3 campus : Cité Scientifique, Campus Santé et Pasteur Lille.
La plateforme Bilille compte 7 ingénieur.e.s temps plein aux profils complémentaires (bioinformaticiens, biostatisticiens, bioanalystes) pour répondre aux besoins des unités de recherche. Les domaines d'activité de Bilille portent notamment sur l'analyse de données -omiques, la biologie intégrative, la phylogénie, la biologie des systèmes, l'imagerie, et la bioinformatique structurale. L'ingénieur.e sera sous la responsabilité directe de l'un des 2 co-responsables techniques de la plateforme. Au cours des projets, l'ingénieur.e interagira directement avec les biologistes encadré.e par un.e référent.e scientifique de la plateforme.
Bilille est une plateforme multi-site avec des bureaux sur les 3 campus lillois. L'ingénieur.e effectuera des rotations hebdomadaires entre ces sites afin de favoriser la proximité avec les équipes de recherche du domaine et les interactions entre les ingénieur.e.s. L'organisation du travail au sein de la plateforme permet la réalisation d'un à deux jours de télétravail par semaine sous réserve de respecter la réglementation en vigueur au CNRS.
Bilille est également membre de l'Institut Français de Bioinformatique (IFB), infrastructure nationale en biologie-santé. L'ingénieur.e contribuera ainsi aux missions nationales et internationales portées par l'IFB et le réseau européen ELIXIR.

Contraintes et risques

Rotation des ingénieurs sur les 3 sites de la plateforme