Missions

Les missions s'exerceront en coordination étroite entre le projet Gaia Data et l'équipe technique du pôle ODATIS (IR Data Terra).
Le/la candidat(e) retenu(e) aura pour mission principale de contribuer à la mise en place d'environnements de traitement interactifs et à distance de type Pangeo pour les données scientifiques du pôle ODATIS de l'IR Data Terra dans le cadre du projet GAIA DATA.

Activités

Services d'accès aux données spécifiques du domaine océan
1. Configuration des accès aux données de data lakes (données satellites, in situ, modèles) : intake/Kerchunk, thredds, erddap
2. Mise en œuvre d'outils et d'API de recherche/sélection de données (Opensearch, STAC)
3. Adaptation d'outils et workflows aux systèmes de fichiers de type cloud (S3) ou réparti (iRODS)
Développements et mise en oeuvre de workflows de traitement scientifique en liaison avec des équipes de recherche
1. Identification et collection des données scientifiques pertinentes
2. Développement de workflow de traitement scientifiques avec Jupyter/Notebook ou Galaxy dans le cadre de cas d'utilisation réels
3. Optimisation de traitements distribués (Dask)
4. Etude des solutions d'interopérabilité pour l'exécution de workflows transverses à plusieurs plateformes distantes et interconnectées
Mise en oeuvre d'un Environnement Virtuel de Recherche (VRE) thématique dans le portail GAIA Data
1. Préparation de tutoriels sur les outils et cas d'usage
2. Participer activement aux groupes de travail VRE du projet GAIA DATA
Participer à la vie du pôle ODATIS (Bureau exécutif, réunion d'équipe projet, …)

Compétences

- Compétences techniques / métiers (savoirs, savoirs faire) :
• Bonne connaissance de la programmation et des environnements de python scientifique : Pangeo, Xarray, numpy, Dask, Jupyter,…
• Bonne connaissance des environnements de calcul haute performance et cloud
• Connaissance d'outils de workflow scientifique (Galaxy)
• Bonne connaissance de l'environnement Linux
• Qualités rédactionnelles et pédagogiques
• Anglais technique écrit et oral de bon niveau

- Qualités personnelles (savoir-être) :
• Rigueur, autonomie et bonne organisation du travail
• Aptitude au travail en équipe pluridisciplinaire
• Intérêt pour le domaine scientifique
• Curiosité, esprit d'initiative, dynamisme, réactivité

Contexte de travail

Le poste proposé est porté par le CNRS, pour le compte du consortium du projet Gaia Data. Les travaux seront menés en collaboration étroite, dans le cadre du pôle de données ODATIS de l'Infrastructure de Recherche française Data Terra, au sein au sein du service service Ingénierie des Systèmes d'Information (ISI) de l'Ifremer à Plouzané, site de référence national du projet GAIA Data.
GAIA DATA est un projet financé par l'ANR EQUIPEX+ / PIA3/France 2030. Il est porté par les trois infrastructures de recherche DATA TERRA, CLIMERI-France et PNDB avec l'ambition de faciliter l'accès aux données multi-sources du système Terre par le développement de produits et services. GAIA Data répond aux enjeux scientifiques d'approches multidisciplinaires et multi-échelles du système Terre, impliquant les composantes atmosphère, océans, surfaces continentales, terre solide, biodiversité et leurs interactions. Le dispositif permettra de gérer l'ensemble du cycle de la donnée, de son acquisition jusqu'à ses multi-usages. Ce dispositif, basé sur des centres de données et services, interconnectés et pilotés par la science, permettra l'accès transparent aux différentes sources de données et de disposer d'un continuum de services distribués de stockage (adaptés aux gros volumes de données pour le spatial et la modélisation notamment), de traitements (incluant l'utilisation des moyens de calculs et d'IA), de post-traitements (notamment le croisement de données), d'analyse et de visualisation. Des services FAIR, adaptés aux besoins des communautés scientifiques, seront proposés sur l'ensemble du cycle de la donnée de son acquisition jusqu'à ses usages multiples.

Composée de 4 pôles thématiques (Atmosphère, Surfaces Continentales, Terre Solide, Océan), l'infrastructure de recherche (IR) « Data Terra - Pôles de données du système Terre » a pour mission principale de mettre à disposition des données, des produits, des logiciels, des outils et des services suivant les besoins exprimés par la communauté. Chaque pôle a ainsi pour objectif de faciliter l'accès aux données satellitaires, aéroportées, in-situ et à partir de prélèvements, notamment celles acquises et gérées par les infrastructures d'observations fédérant les Services Nationaux d'Observations (SNO), la flotte océanographique, les avions et les missions spatiales. L'infrastructure Data Terra vise également à renforcer le positionnement de la communauté française dans le paysage européen.
Le pôle Océan - ODATIS se propose d'être le point d'entrée unique pour l'accès aux données et services d'observation de l'océan. Le CNES, le CNRS, le CEREMA, l'Ifremer, l'IRD, Météo France, le SHOM et le consortium des Universités Marines en sont les principaux partenaires et contributeurs.

L'activité se déroulera en étroite collaboration avec les partenaires du projet GAIA Data, l'IR Data Terra et le pôle ODATIS et le département IRSI de l'Ifremer.

Informations complémentaires

Le poste se situe sur le site de BREST.