Missions

La personne recrutée concevra et réalisera des techniques de phénotypage par imagerie. Elle réalisera aussi des techniques pour l'avancement des programmes d'édition de génome par CRISPR-Cas9 chez le poisson-zèbre.

Activités

Tâches principales:
- Assurer le suivi des prestations d’imagerie
- Réaliser des expériences de marquage fluorescent sur des échantillons de poisson-zèbre.
- Réaliser des acquisitions d’image par microscopie confocale d’échantillons transparisés.
- Analyser les données et mettre en forme les résultats avant le rendu aux utilisateurs
- Procéder à l'optimisation, à l'étalonnage et au réglage des microscopes
- Développer des méthodes visant à optimiser les montages, accélérer l’acquisition et augmenter le nombre d’échantillons.
- Réaliser les expériences de biologie moléculaire pour l’avancée des projets d’édition du génome.
- Assurer le suivi et le génotypage des animaux génétiquement édités

Tâches secondaires:
- Établir les devis pour les utilisateurs.
- Assurer le suivi des prestations de recherche de la plateforme aussi bien pour les utilisateurs de l'unité que pour les besoins liés aux recherches propres de l'unité.
- Rédiger des notes techniques à destination des utilisateurs de la plateforme,
- Assurer une veille scientifique et technologique dans les domaines du phénotypage et de l'édition de génome

Compétences

Savoirs / Savoir-faire
- Formation généraliste en biologie, microscopie et génétique
- Maîtrise pratique de la microscopie à fluorescence
- Maitrise pratique des analyses 3D imagerie
- Maitrise pratique de la mise en oeuvre de l’imagerie HCS
- Maitrise pratique de la maintenance de premier niveau sur microscope confocal
- Bonnes connaissances de l’utilisation des logiciels d’acquisition et d’analyse d’images (Image J, Imaris)
- Connaissance théorique et pratique des techniques de transgénèse et d'édition de génome en particulier chez les vertébrés aquatiques.
- Maîtrise des techniques de génotypage.
- Connaissance théorique et maîtrise pratique des protocoles de biologie moléculaire de base (PCR, extraction d'acides nucléiques, ...)
- Connaissance des outils bio-informatiques du domaine.
- Connaissance des principes éthiques et des réglementations afférentes à la production et l'utilisation d'animaux OGM.
- Connaissances des règles d'hygiène et de sécurité liées à la manipulation d'animaux (en particulier OGM) et au travail sous hotte chimique
- Maîtrise des règles de communication écrite et orale.
- Anglais, B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)

Savoirs-être
- Communiquer au sein du service et avec ses interlocuteurs externes (chercheurs, ingénieurs, techniciens, étudiants et post-doctorants des équipes de recherche)
- Sens de l’organisation
- Travail en équipe
- Autonomie, force de proposition

Contexte de travail

L'UAR2010 TEFOR Paris-Saclay est une unité d’appui et de recherche qui promeut l'utilisation des modèles aquatiques (poisson-zèbre et xenopes principalement) en recherche fondamentale, agronomique et médicale. L'unité propose des services d’édition du génome par CRISPR-Cas9 pour la production de lignées d’intérêt et des services de phénotypage à échelle moyenne via imagerie confocale et reconstruction 3D de tissus. L’ingénieur intègrera la plateforme technologique et réalisera son activité principale en phénotypage par imagerie mais participera également aux missions de l’équipe d’édition du génome.

Contraintes et risques

Déplacements à l’étranger possible (1 fois par an), déplacements en France (4 fois par an maximum), réunions régulières en Ile-de-France, travail possible en heures non ouvrées.
Utilisation de produits CMR, ports d’équipement de protection individuels, utilisation de sorbonne chimique, travail en animalerie aquatique