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Portail > Offres > Offre UAR1589-SOPSIE-004 - Ingénieur H/F en analyse protéomique

Ingénieur H/F en analyse protéomique


Date Limite Candidature : lundi 29 juillet 2024 23:59:00 heure de Paris

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Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur H/F en analyse protéomique
Référence : UAR1589-SOPSIE-004
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : STRASBOURG
Date de publication : lundi 8 juillet 2024
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 2 septembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : A partir de 2875.89 € selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac+5 et plus)
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en plateforme scientifique

Missions

L’ingénieur(e) de recherche rejoindra l’équipe de la plateforme protéomique de l’Esplanade, basée à l’IBMC et réalisera les analyses protéomiques.
Les analyses LC MSMS sont de type DDA (Data dependant Acquisition) et DIA (Data Independant Acquisition), de la préparation d’échantillons protéiques, au pilotage instrumental et à l’analyse bio-informatique pour identification, quantification et validation statistique.

Activités

- Préparation d’échantillon : lyse à façon d’échantillons protéiques divers, digestion enzymatique des échantillons.
- Pilotage des systèmes HPLC MS/MS de la plateforme : calibration, paramétrage, entretien. Le parc instrumental est constitué de 2 spectromètres de masse : un Orbitrap Q exactive plus (Thermo Fischer Scientific) et un TIMS TOF pro2 (Bruker)
- Analyse bio-informatique : analyse des données de spectrométrie de masse avec suite de logiciels dédiés à l’analyse DDA, Suite logiciels Mascot-Proline- Prostar à l’analyse DIA (logiciels DIANN), réaliser les analyses statistiques pour valider les résultats de quantification et rédaction de protocole
- réaliser des développements méthodologiques en analyse protéomique (nouveaux protocoles dédiés à l’implémentation de nouvelles applications d’analyse protéomiques : Modifications post traductionnelles, pipeline statistique, etc…)
- Rédaction de rapports clairs et compréhensibles pour les utilisateurs.
- Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports pour les utilisateurs, publications, présentations orales
- Participation à la vie de la plateforme : gestion et commande des consommables
- Participation aux actions de formation et de communication (concevoir et animer)
- Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité
- Appliquer les principes et règles des bonnes pratiques de laboratoire et d'hygiène & sécurité

Compétences

- solides connaissances théoriques et pratiques en analyse protéomique : une expérience pour l’acquisition DDA et DIA est nécessaire.
- savoir utiliser l'outil informatique : logiciels d’analyse protéomique, statistiques sur le logiciel « R », tableur, traitement de texte, conception de diaporama
- Bonnes capacités relationnelles et sens du contact, esprit d’équipe et esprit d’initiative, rigueur expérimentale.
- Bon niveau de communication orale et écrite en anglais, niveau B1 ou plus

Contexte de travail

La plateforme protéomique Strasbourg Esplanade fait partie de l'unité d'appui et de recherche de l'IBMC (UAR 1589), regroupant les services communs et les plateformes technologiques. Cette plateforme est mutualisée et réalise les analyses protéomiques des équipes de recherche du campus. L’Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire (220 personnes) héberge également 3 unités de recherche : UPR3572 I2CT (Immunologie Immunopathologie et Chimie Thérapeutique), UPR9022 M3I (Modèles Insectes d’Immunité Innée) et UPR9002 ARN (Architecture et Réactivité de l’ARN). L’ingénieur(e) sera placé -e sous l’autorité hiérarchique du responsable de la plateforme protéomique.