En poursuivant votre navigation sur ce site, vous acceptez le dépôt de cookies dans votre navigateur. (En savoir plus)
Portail > Offres > Offre FR550-BRUMIR-011 - Post-doctorat "Biogénèse membranaire dans le modèle AtpF chez E. coli et Chlamydomonas reinhardtii." (H/F)

Post-doctorat "Biogénèse membranaire dans le modèle AtpF chez E. coli et Chlamydomonas reinhardtii." (H/F)

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : vendredi 29 octobre 2021

Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler. Les informations de votre profil complètent celles associées à chaque candidature. Afin d’augmenter votre visibilité sur notre Portail Emploi et ainsi permettre aux recruteurs de consulter votre profil candidat, vous avez la possibilité de déposer votre CV dans notre CVThèque en un clic !

Faites connaître cette offre !

Informations générales

Référence : FR550-BRUMIR-011
Lieu de travail : PARIS 05
Date de publication : vendredi 17 septembre 2021
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2022
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Les salaires bruts varieront en fonction de l'expérience du candidat à partir de 3106€/mois (environ 2500€ net) pour un candidat ayant moins de 2 ans d'expérience post-doctorale. Consultez le barème officiel CNRS des salaires des chercheurs sur : http://labexdynamo.ibpc.fr/fp-dynamo-paris/
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Attention: vous ne devez pas avoir résidé ou exercé votre activité principale (par exemple travail ou études) en France pendant plus de 12 mois au cours des 3 années précédant la date de recrutement.
Vous avez une expérience de la recherche dans le domaine concerné par l'annonce.

Biogénèse membranaire dans le modèle AtpF chez E. coli et Chlamydomonas reinhardtii.
responsables et encadrement: Francesca Zito zito@ibpc.fr et Bruno Miroux, miroux@ibpc.fr UMR7099.

Au sein du laboratoire de Biologie Physico-Chimique des Protéines Membranaire (UMR7099) de l'ENS et en collaboration étroite avec le laboratoire P.A.S.T.E.U.R. de l'ENS-Paris et plusieurs collaborateur étrangers, le projet propose un travail de post-doctorat sur l'étude de la biogénèse membranaire dépendante d'AtpF, la sous unité b de l'ATP-synthase d'E. coli, dans deux microorganismes modèles : E. coli et Chlamydomonas reinhardtii.
La "révolution" dans la résolution de la microscopie cryo-électronique ouvre de nouvelles voies pour observer les protéines membranaires (MPs) dans les membranes natives (1). Notre laboratoire a contribué à l'analyse des MPs par cryo-microscopie électronique en développant un surfactant alternatif appelé amphipol et en améliorant génétiquement des hôtes d'expression bactériens (2, 3). Nous proposons ici d'étudier la biogenèse membranaire dans le "modèle AtpF". La surproduction de la sous-unité b de la FoF1-ATP synthase, AtpF, induit une prolifération massive de la membrane intracellulaire (ICM) dans l'hôte C43(DE3) (4), et des résultats préliminaires indiquent que l'expression d'AtpF dans le chloroplaste de C reinhardtii pourrait également façonner l'organisation de la membrane de ses thylakoïdes. En fonction de sa motivation et de ses compétences, le boursier FP-DYNAMO aura l'opportunité de développer son projet dans plusieurs directions : i la tomographie sur les deux modèles, le chloroplaste de Chlamydomonas est un matériel parfait pour étudier l'architecture des thylakoïdes par cryo-microscopie ; ii, des approches omiques ; iii, la génétique, par perturbation sélective de gènes candidats impliqués dans la biogénèse membranaire ; iv, des approches biochimiques et de biologie synthétique. Notre projet à long terme est de contribuer à l'élucidation des mécanismes moléculaires fondamentaux de la prolifération des membranes au cours de l'évolution et de les appliquer à la construction d'un organite membranaire synthétique (5).

Publications liées au sujet
1. Le Bon C, Michon B, Popot J-L, Zoonens M. 2021. Amphipathic environments for determining the structure of membrane proteins by single-particle electron cryo-microscopy. Q Rev Biophys 54:e6.
2. Angius F, Ilioaia O, Amrani A, Suisse A, Rosset L, Legrand A, Abou-Hamdan A, Uzan M, Zito F, Miroux B. 2018. A novel regulation mechanism of the T7 RNA polymerase based expression system improves overproduction and folding of membrane proteins. Sci Rep 8:8572.
3. Dilworth MV, Piel MS, Bettaney KE, Ma P, Luo J, Sharples D, Poyner DR, Gross SR, Moncoq K, J F Henderson P, Miroux B, Bill RM. 2018. Microbial expression systems for membrane proteins. Methods San Diego Calif 147:3–39.
4. Carranza G, Angius F, Ilioaia O, Solgadi A, Miroux B, Arechaga I. 2017. Cardiolipin plays an essential role in the formation of intracellular membranes in Escherichia coli. Biochim Biophys Acta 1859:1124–1132.
5. Royes J, Ilioaia O, Lubart Q, Angius F, Dubacheva GV, Bally M, Miroux B, Tribet C. 2019. Bacteria-Based Production of Thiol-Clickable, Genetically Encoded Lipid Nanovesicles. Angew Chem Int Ed Engl 58:7395–7399.

Activités

- analyser la morphologie et quantifier la prolifération membranaire chez E. coli et Chlamydomonas reinhardtii
- déchiffrer les déterminants génétiques de la prolifération membranaire chez E. coli et Chlamydomonas reinhardtii
- développer des applications de nanovésicules vectorisées et/ou fonctionalisées
- écrire des articles scientifiques pour des journaux internationaux à comité de lecture

Compétences

savoir/connaissances:
- Connaissances générales en biologie et microbiologie
- Connaissances approfondies en biochimie et dans le domaine des systèmes membranaires
- Connaissances en biologie moléculaire
- Maitrise de l'anglais scientifique (lecture et rédaction)
- Connaissance de base en traitement de données numériques
- Une expérience préalable en microscopie et/ou protéomique sera un plus

Savoir Faire
- Concevoir et mettre en œuvre les protocoles expérimentaux
- Capacités d'analyse et de restitution des informations (tenue d'un cahier de laboratoire, préparation de tableaux de synthèse des résultats, préparation de présentations orales).
- Préparer des articles pour publication dans des revues internationales à comité de lecture
- effectuer des analyses quantitatives et statistiques sur les lots d'images de microscopie et sur les données collectées.

Savoir-être
- travailler en équipe, notamment en collaboration multi-laboratoire,
- organiser et planifier son travail de manière autonome;
- présenter ses résultats sous forme de rapports scientifiques clairs et circonstanciés.

Contexte de travail

Le travail sera effectué en majorité dans l'UMR7099 « Laboratoire de Biologie Physico-Chimique des protéines Membranaires », dirigé par Bruno Miroux à l'Institut de Biologie Physico-Chimique à Paris http://www.ibpc.fr/UMR7099. Ce laboratoire, situé au cœur du quartier latin regroupe un peu plus de 25 personnes dont 19 membres statutaires. Le projet se fera sous la direction de Francesca Zito et Bruno Miroux.

Le projet s'inscrit dans le programme COFUND FP-DYNAMO-PARIS, initiative pour la recherche fondamentale, qui offre un environnement interdisciplinaire dans le centre de Paris afin de former les scientifiques de demain dans le domaine de la biologie physico-chimique. Le but de ce programme de recherche est d'intégrer les connaissances sur l'expression génétique, la biologie membranaire et structurale, et la bioénergétique chez les bactéries, les chloroplastes et les mitochondries dans le contexte général d'améliorer notre compréhension de la biogenèse des membranes transductrices d'énergie. Ces études impliquent l'utilisation de technologies de pointes incluant la biologie structurale (NMR, cristallographie aux rayons X et CryoEM), la transcriptomique, la spectrométrie de masse, la biologie synthétique, la microfluidique, la modélisation computationnelle et la visualisation. Les chercheurs post-doctoraux auront l'opportunité de développer leurs projets de recherche dans un environnement scientifique dynamique couvrant trois thèmes de recherche principaux: i) La biologie de l'ARN des bactéries aux chloroplastes, ii) La dynamique des systèmes membranaires et iii) la modélisation computationnelle des assemblages moléculaires.
Les chercheurs post-doctoraux auront l'opportunité de développer leurs projets de recherche dans un environnement scientifique dynamique couvrant trois thèmes de recherche principaux: i) La biologie de l'ARN des bactéries aux chloroplastes, ii) La dynamique des systèmes membranaires et iii) la modélisation computationnelle des assemblages moléculaires. Ils bénéficieront de l'encadrement d'experts reconnus internationalement dans leurs domaines, d'un réseau mondial d'institutions de renom, d'infrastructures de recherche et d'un savoir-faire technique de pointe qui leur permettront de perfectionner leurs compétences scientifiques, de se faire connaître et d'accroître leur compétitivité sur le marché du travail. Une formation spécifique sera proposée aux post-doctorants à travers la participation au cours EMBO sur « Le leadership de laboratoire pour les postdoctorants » lors d'une retraite à Padoue, et par leur participation à des événements de formation complémentaires dédiés aux compétences non techniques.

Contraintes et risques

Le contrat doit démarrer entre le 1er Janvier 2022 et le 31 Mai.

Informations complémentaires

Modalités de candidature
Le dossier de candidature est à rédiger en anglais et à déposer sur le site https://emploi.cnrs.fr/. Il doit comporter un CV détaillé, un minimum de deux lettres de référence, une lettre de motivation décrivant vos objectifs de carrière à court et long terme, ainsi qu'une déclaration signée spécifiant que vous êtes en conformité avec la règle de mobilité qui stipule que vous n'avez pas résidé ou exercé votre activité principale (travail ou études) en France pendant plus de 12 mois au cours des trois années précédant la date du recrutement. Le dossier complet doit aussi être envoyé à Bruno MIROUX & Magdalena TORTYNA, respectivement directeur et manager du projet à l'adresse mail DYNAMOcofund@ibpc.fr (Tel: 33 1 58 41 50 64). Voir détails sur le site http://labexdynamo.ibpc.fr/fp-dynamo-paris/

Evaluation
Le poste est conçu comme une première étape dans une carrière de chercheur, et l'évaluation des candidats sera principalement basée sur leurs qualifications en recherche et leurs compétences pouvant compléter et renforcer la recherche en cours au sein des institutions partenaires.

Étape 1. Les candidatures de chaque candidat éligible seront évaluées par des experts internationaux indépendants au sein du thème de recherche concerné. Les candidats éligibles seront évalués en fonction de leur mérite, de leur motivation pour le programme, de leur excellence académique et de leurs qualifications personnelles telles que leur aptitude à collaborer et communiquer.

Étape 2. Un maximum de trois candidats sera retenu pour un entretien vidéo avec les experts indépendants pour chaque poste ouvert (novembre 2021). Après l'entretien, les candidats de la liste restreinte seront invités à une conférence à distance avec le directeur de projet et un membre du conseil d'administration de DYNAMO pour définir le périmètre général du projet, de la formation et de l'environnement de recherche. Les candidats devront rédiger une proposition de projet de 3 pages, apportant leurs propres idées originales, et disposeront de 2 semaines pour la soumettre.

Étape 3. Chaque proposition de projet sera évaluée par l'un des experts indépendants et le membre du conseil d'administration de DYNAMO qui aura évalué le candidat lors des étapes précédentes. La sélection finale sera faite sur la base des notes obtenues aux étapes 1, 2 et 3. La note minimale doit être supérieure à 20/40. Le meilleur candidat se verra offrir le poste de postdoctorant avec une date de début allant du 1er janvier au 31 mai 2022.

Le CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique) est un employeur souscrivant au principe de l'égalité d'accès à l'emploi. Par ailleurs, FP-DYNAMO-PARIS s'engage à promouvoir le rôle des femmes dans la science et ainsi encourage explicitement celles-ci à se porter candidates.

On en parle sur Twitter !