Missions

L’ingénieur·e d’étude, qui aura une expérience concrète en cytométrie en flux et tri cellulaire, assumera la responsabilité de la cytométrie en flux au sein de la plateforme.
Il·elle sera l’interlocuteur·trice privilégié·e des utilisateurs dans la mise en place des projets nécessitant l’utilisation de la cytométrie en flux sur la plateforme. Il elle devra guider des équipes dans cette technologie et les accompagner depuis le design des expérimentations jusqu’à l’analyse des résultats. Les utilisateurs travaillent à l’IMEV utilisent principalement des modèles atypiques (types microalgues et autres protistes animaux marins invertébrés dissociées ou embryonnaires…). L’ingénieur-e exercera ses missions sous la responsabilité de la responsable scientifique de la PBM.

Activités

Les activités de l’ingénieur·e d’étude seront centrées sur l’organisation des prestations de cytométrie en flux.

- Assurer le bon fonctionnement du plateau cytométrie en flux au sein de la plateforme : en assurant la gestion des équipements mis à disposition (maintenance, calibrations, gestion des pannes, échanges avec les industriels).
- Assurer la formation initiale et/ou continue en cytométrie en flux auprès des utilisateurs et les assister pour l’utilisation du cytomètre en flux et du trieur de cellules avec les logiciels dédiés.
- S’intégrer dans les réseaux professionnels pertinents (Cytexpert, AFC, Purdue list, etc).
- Assister les utilisateurs dans la mise au point de leur plan d’expérience en fonction des questions scientifiques posées.
- Participer à la gestion financière de la plateforme (tarification, devis, facturation) en accord avec les règles comptables de l'organisme.
- Appliquer et s’assurer de l’application des règles d’hygiène et sécurité.
- Participer aux tâches communes (gestion des stocks et déchets, commandes, démarche qualité).
- Assurer une veille technologique.
- Contribuer, en collaboration avec les autres membres de la plateforme et la direction de la fédération, à la rédaction de dossiers de demandes de financement et des rapports d’activité.

Compétences

- Maîtrise des principes de la cytométrie en flux et en tri cellulaire
• Microbial ecology application
• Sorting of embryonic cells
• Use of Reference Controls
• Double/triple staining experiments
• Data analysis

- Connaissances en cytométrie spectrale
• Full Spectrum Profiling
• Spectral Unmixing
• Data Analysis
- Connaissances de la démarche de qualité d’une plateforme EMBRC
- Maîtrise des outils informatiques et des logiciels d’analyses de cytométrie en flux et spectrale

Savoir-faire :
- Utilisation et maintenance de cytomètres en flux (analyseurs et trieurs)
- Expérimentation et panel design.
- Analyse des données issues des acquisitions en cytométrie en flux.
- Formation des utilisateurs en cytométrie en flux.
- Connaissances des bonnes pratiques de laboratoire.
- Suivi des protocoles et des procédures techniques.
- Rendre compte de son activité.
- Langue anglaise : de B1 à C1 (cadre européen de référence pour les langues).

Savoir-être :
- Organisation et rigueur
- Capacité à travailler en équipe
- Disponibilité et réactivité pour répondre aux besoins des utilisateurs
- Autonomie dans le travail (gestion de l’instrument et organisation des analyses)

Contexte de travail

L’Institut de la Mer de Villefranche (IMEV – ex-Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer) est une fédération de recherche (FR3761) et une composante de Sorbonne Université qui a pour mission la recherche, l’observation, la formation, la dissémination des connaissances et l’accueil de scientifiques et d’étudiants.
Pour ce faire, l’IMEV dispose de différents services et structures ainsi que de ressources d’hébergement (44 chambres)
Les thématiques de recherche et d’enseignement qui y sont conduites recouvrent l’océanographie, dans ses divers aspects biologiques, chimiques et physiques, ainsi que la biologie cellulaire et du développement.

Dans le cadre du projet AO-EMBRC, il a été proposé de développer des Observatoires Marins Augmentés de pointe à trois endroits stratégiques le long du littoral français : aux stations marines de Villefranche-sur-Mer (IMEV) et de Banyuls-sur-Mer (OOB) et à Roscoff (SBR), qui sont intégrés à l’infrastructure de recherche (IR) du Centre National de Ressources Biologiques Marines (EMBRC-France). Dans ce cadre, l’IMEV a récemment acquis un cytomètre trieur spectral Aurora CS Cytek, et recrute un.e ingénieur.e d’études responsable de la cytométrie.
Ce poste est rattaché à la Plateforme de Biologie Moléculaire (PBM) de l’IMEV. La Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche sur Mer existe depuis 2018. Elle est labellisée au sein de l’Infrastructure de Recherche EMBRC-France et EMBRC Europe (ERIC). PBM propose des services de génotypage, de clonage de cDNA et de soutien technique à différents appareils.
L’équipe de la PBM se compose d’un chercheur (Référent scientifique) et de 3 ITAs.

Contraintes et risques

Risques liés aux agents biologiques, chimiques
Risque lié au travail sur écran