Ingénieur de recherche en traitement bioinformatique et analyse statistique de données omiques (H/F)

Job Description

Missions

Assurer le recueil, le traitement et l"analyse des données omiques sur les projets associant la plateforme bioinformatique du CBI. L'agent sera en contact direct avec les biologistes porteurs de projet et sera chargé des données de séquençage. Il/Elle travaillera sur plusieurs projets simultanément dans des domaines variés tels que : transcriptomique, génomique, épigénomique, protéomique, assemblage De Novo …

Activity

• Assurer le recueil, le contrôle des données et organiser leur stockage
• Réaliser le traitement des données brutes en utilisant ou développant des chaînes de traitement des données, de la collecte à l’analyse statistique
• Choisir et appliquer les méthodes statistiques existantes les plus pertinentes sur les données et les plus performants pour le projet
• Diffuser et valoriser des résultats sous forme de rapports techniques, Participer à l’interprétation des résultats et à la rédaction des synthèses de présentation des analyses statistiques.
• Gérer et maintenir des outils informatiques partagés, notamment participer à l'administration du serveur de calcul
• Conseiller et former aux outils utilisés et effectuer des présentations pour assurer un transfert de compétences
• Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine d'activité
• Assurer un contrôle qualité sur les résultats produits
• Participer à des réseaux professionnels, collaboratifs (en interne et en externe)

Your Profil

Skills

Savoirs / connaissances :
• Techniques informatiques de recueil, analyse et traitement des données omiques, en particulier transcriptomiques, génomiques et épigénomiques
• Expérience ou connaissances générales en biologie, notamment biologie des génomes
• Langages de programmation (R et/ou Python, bash)
• Langue anglaise : écrit et oral    

Savoir-faire :
• Traiter des données transcriptomique ou épigénomique
• Programmer dans différents environnements informatiques, notamment sur un serveur ou sur un cluster de calcul, maîtriser l'environnement Linux
• Garantir la qualité et la pertinence des outils d’analyse et des résultats, ainsi que la reproductibilité
• Rédiger la documentation pour les utilisateurs et Réaliser des synthèses    

Savoirs-être :
• Transmettre des connaissances et utiliser les techniques de présentation
• Capacité à interagir de façon étroite avec les biologistes
• Assurer une veille
• Travailler en équipe

Your Work Environment

Les équipes du Centre de Biologie Integrative (CBI) de Toulouse développent des approches multidisciplinaires, multi-échelles des molécules isolées aux organismes entiers et aux sociétés animales dans le but de comprendre le fonctionnement des organismes vivants. L’utilisation de technologies de séquençage est nécessaire à la poursuite de nombreux projets. La plateforme bioinformatique du CBI est dédiée à l’analyse de ces données permet à tous d’utiliser ces approches devenues incontournables dans de nombreux champs d’investigation de l’ensemble des équipes du CBI.

Sous la responsabilité hiérarchique du responsable technique de la plateforme, l'Ingénieur-e rejoindra une équipe de 3 à 4 personnes pour développer les méthodes d'exploitation et d'analyse des données générées par les équipes de recherche du CBI et les utilisateurs extérieurs de la plateforme. Chacune de ces missions sera réalisée en liaison étroite avec les biologistes des équipes de recherche.

Constraints and risks

• Travail sur écran
• Interaction avec différentes équipes, différents services, différents public (biologistes, informaticiens)

Compensation and benefits

Compensation

Entre 3143.64 € et 3403.43 € brut mensuel selon l'expérience

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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