Missions

L'ingénieur/ingénieure réalisera des analyses protéomiques sur différents spectromètres de masse présents sur la Plateforme Protéomique de l'Institut de Microbiologie de la Méditerranée, et participera ainsi aux divers projets réalisés sur la plateforme dont en particulier l'étude de protéines impliquées dans les mécanismes de concentration du CO2 chez les microalgues.

Activités

-Réaliser des analyses d'identification et de quantification relative de protéines par la démarche protéomique « Bottom-up » sur des spectromètres de masse haute résolution couplés à des nano-chromatographies liquides
-Réaliser des mesures de masses globales de protéines isolées, par spectrométrie de masse MALDI-ToF ou electrospray- Q-ToF en conditions natives
-Participer à la maintenance des instruments scientifiques
-Mettre en œuvre les méthodes pour l'étude d'interactomes (Proximity-labelling/Cross-linking avec divers cross-linkers), pour la protéomique quantitative après marquage isotopique, et pour la protéomique structurale (caractérisation de modifications chimiques et post-traductionnelles)
-Réaliser les traitements bio-informatiques associés aux données scientifiques acquises par divers logiciels spécifiques et rédiger des rapports
-Rédiger ou compléter des tutoriaux
-Se tenir au courant des développements en spectrométrie de masse et des logiciels associés
-Participer à l'évolution de procédures dans le cadre de la démarche qualité (certification Norme ISO-9001 et NFX-50900 en cours)

Compétences

-Avoir des connaissances théoriques et pratiques en biochimie des protéines
-Avoir des connaissances théoriques et pratiques en spectrométrie de masse et en chromatographie liquide
-Connaître l'environnement bureautique (stockage/archivage de données) et maîtriser les logiciels bureautiques courants (Excel, Word, Powerpoint…)
-Savoir s'organiser dans un travail multi-tâches : suivre un plan d'expériences, collecter des résultats et savoir rédiger un rapport ou un tutorial
-Savoir agir avec rigueur dans la gestion de centaines d'échantillons, avec le respect d'un cahier des charges
-Savoir communiquer et travailler en équipe
-Pratiquer la veille scientifique
-Connaissance de l'anglais technique et scientifique

Contexte de travail

L'activité s'exerce au sein de l'Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM), Fédération de Recherche FR3479, composé de 4 UMR (BIP, IGS, LCB, LISM, environ 300 personnes) localisé sur le site du Campus Joseph Aiguier de la Délégation du CNRS à Marseille (9e arrondissement). La plateforme fait partie du réseau de plateformes protéomiques marseillaises, Marseille-Protéomique labellisée IBiSA et Aix- Marseille Université, et interagit avec toute la communauté scientifique régionale publique (CNRS, Université d'Aix-Marseille, INSERM, INRA, CEA) et privée, voire nationale et internationale. La Plateforme de l'IMM est composée de 3 ingénieurs dont la Responsable Technique, et un Responsable Scientifique.