Missions

L'ingénieur-e viendra renforcer l'activité de microscopie photonique de la plateforme d'Imagerie ImagoSeine. Il/elle aura une mission de conseil, d'assistance et de formation auprès des utilisateurs. Il/elle développera et conduira des approches méthodologiques de pointe en microscopie photonique pour répondre aux besoins des équipes de recherches de l'IJM et de la communauté scientifique environnante publique et privée.

Activités

- Former les utilisateurs (doctorants, chercheurs, ingénieurs et techniciens) aux différents systèmes d'imagerie disponibles afin de les rendre autonomes ;
- Orienter les utilisateurs vers les systèmes les plus adaptés, définir en expert les limites de ces techniques et les interprétations des données collectées ;
- Concevoir et optimiser avec les équipes utilisatrices de nouveaux protocoles d'imagerie cellulaire (préparation des échantillons, acquisition des données, analyse et traitement des données) ;
- Participer à l'entretien, la maintenance et le bon fonctionnement des appareils, à la réalisation des tests de contrôle de performance et à la rédaction des notes techniques sur les différents systèmes et approches expérimentales ainsi que des tutoriaux ;
- Participer à la gestion de l'utilisation des appareils : réservation du planning, liaison SAV... ;
- Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine de l'imagerie ;
- Appliquer et faire appliquer le règlement de l'utilisation de la plateforme et les règles d'hygiène et sécurité ;
- Participer à des réseaux professionnels d'échange de savoirs et de savoir-faire en microscopie photonique ;
- Animer des actions de formation et d'enseignement sous l'égide des organismes de tutelle ;
- Participer à l'animation des réseaux professionnels d'échange de savoirs et de savoir-faire ;
- Diffuser et valoriser les résultats des développements technologiques

Compétences

Savoirs :

- Connaissances théoriques en microscopie photonique sur échantillon fixé ou vivant (microscopie champ-large, confocale, spinning disk, si possible multi-photons, FRAP, FLIM) ;
- Connaissance théorique en images numériques, traitement du signal, traitement et analyse d'images
- Connaissances générales en biologie et connaissance si possible sur certains des modèles présents dans l'Institut (levure, paramécie, cellules mammifères, organoïdes, embryons de Drosophile, de poulet, d'oursins, de souris, C. elegans, planaires) ;
- Connaissance du cadre légal et déontologique, des règles d'hygiène et sécurité.

Savoirs faire :

- Connaissances pratiques en microscopie photonique sur échantillon fixé ou vivant (microscopie champ-large, confocale, spinning disk, multi-photons, FRAP) ;
- Maîtrise des logiciels dédiés à l'acquisition d'images (NIS, Zen, ...) ;
- Maîtrise des logiciels de visualisation et traitement d'images (ImageJ, Imaris, Cellpose, Ilastik, Napari,¿.) ;
- Connaissances en programmation ou en langage de scripting ;
- Bon niveau d'expression et de compréhension écrite et orale en anglais (utilisateurs et fournisseurs anglophones) ; Niveau B1
- Capacités d'analyse et de synthèse

Savoirs-être :

- Bon sens relationnel et qualités pédagogiques
- Aptitude au travail en équipe
- Capacités d'écoute et disponibilité auprès des utilisateurs
- Rigueur technique et sens de l'organisation
- Motivation et enthousiasme
- Capacités d'adaptation dans un environnement multidisciplinaire

Contexte de travail

L'activité s'exercera au sein de l'Institut Jacques Monod (http://www.ijm.fr ), unité mixte de recherche CNRS - Université Paris Cité. Le laboratoire est hébergé dans un bâtiment situé dans le 13ème arrondissement de Paris.
ImagoSeine est la plateforme de service et de R&D en imagerie de l'Institut Jacques Monod https://imagoseine.ijm.fr/ . ImagoSeine réunit en un même lieu des ressources en cytométrie en flux, microscopie électronique et microscopie photonique. ImagoSeine est une plateforme labellisée IBiSA, membre de l'infrastructure nationale des plateformes d'imagerie « France-BioImaging » et du réseau « Euro- BioImaging ».
La plateforme propose et développe des prestations de haut niveau permettant la visualisation et l'analyse de la structure, de la dynamique, des interactions et des fonctions des échantillons biologiques. Le pôle Microscopie Photonique dispose de trois appareils confocaux à balayage, un confocal multiphoton et photo-ablation, trois confocaux « spinning disk », un système FLIM et FCS, un système de super résolution (SIM, PALM/STORM), un microscope plein champ et d'un plateau informatique et de traitement des images.
La plateforme ImagoSeine est placée sous la co-responsabilité d'un directeur de recherche CNRS et d'un professeur d'Université Paris Cité, coordinateurs des trois activités de la plateforme. L'ingénieur-e dépendra hiérarchiquement du responsable de l'activité de microscopie photonique. Il/Elle intégrera une équipe dynamique disponible et motivée.
L'activité de la plateforme peut nécessiter des contraintes d'horaires, d'organisation du temps de travail, de ponctualité.
Des déplacements occasionnels sont à prévoir à Paris dans le cadre d¿une activité de réseau métier en France pour des formations et la participation à des journées scientifiques.