Missions

L'ingénieur biologiste (H/F) mettra en œuvre et développera des méthodologies de microbiologie,
biologie moléculaire et biochimie, qui s'inscriront dans les projets de recherche de l'équipe «
Systèmes d'adaptation des bactéries » (BIP1). Il/Elle participera également à l'organisation pratique
de l'équipe.

Activités

1) Participer aux projets scientifiques de l'équipe d'affectation.
- Concevoir, développer, optimiser et mettre en œuvre des protocoles expérimentaux dans les domaines
suivants :
o Microbiologie : cultures et expérimentations (croissances aérobies et anaérobies, survies,
microscopie,..) en laboratoire BSL-1 et BSL-2 sur divers organismes bactériens, notamment E. coli,
S. oneidensis ainsi que d'autres modèles environnementaux, commensaux ou pathogènes.
o Biologie moléculaire et génétique : clonage, délétion et surexpression de gènes, qRT-PCR,..
o Biochimie : purification de protéines, Western blot, dosage d'activités enzymatiques, analyses
d'interactions protéine-protéine, analyse des métaux...
- Assurer la formation et le transfert de compétences auprès des membres et des nouveaux arrivants
au sein de l'équipe d'affectation.

2) Exploiter et valoriser les résultats expérimentaux.
- Consigner l'ensemble des expériences dans un cahier de laboratoire électronique pour en garantir
le suivi et la qualité.
- Analyser, interpréter et synthétiser les résultats expérimentaux obtenus.
- Présenter les données et conclusions lors des réunions d'équipe.
- Participer à la diffusion, à la valorisation et à la rédaction des résultats dans le cadre de
publications scientifiques.

3) Prendre en charge l'organisation matérielle de l'équipe de recherche.
- Gérer les consommables/milieux de culture nécessaires aux activités de recherche.
- Veiller à l'entretien, au suivi, à la maintenance et au renouvellement des équipements.
- Garantir l'application des principes et des règles d'hygiène et de sécurité.
- Participer à la gestion et à l'élimination des déchets biologiques et chimiques.
- Assurer une veille scientifique et technologique afin d'optimiser les pratiques et les équipements
du laboratoire.

Compétences

Savoirs :
- Connaissances approfondies en microbiologie, biologie moléculaire, génétique bactérienne, et
biochimie
- Connaissances des risques, de la réglementation et des règles d'hygiène et sécurité propres au
domaine
- Connaissance des règles de déontologie, d'éthique et des exigences réglementaires liées à la
recherche
- Bon niveau d'anglais technique (niveau B2)

Savoir-faire :
Maitrise des techniques de :
- Microbiologie bactérienne, dont cultures bactériennes en milieux liquides et solides
anaérobie/aérobie, utilisation de chambre anaérobie, sélection, identification de souches
bactériennes
- Biologie moléculaire et génétique, dont PCR, clonages, mutagenèse dirigée, délétion de gènes,
transformation, conjugaison
- Biochimie, dont électrophorèses, Western blot, production et purification de protéines, co-
purifications, analyse et quantification de métaux par ICP-OES
- Analyse et mise en forme des résultats ; tenue d'un cahier de laboratoire électronique
- Utilisation des logiciels de bureautique et des outils d'analyse de données

Savoir être :
- Esprit d'équipe, sens du collectif et motivation pour contribuer à la vie du laboratoire
- Rigueur, fiabilité et sens des responsabilités
- Capacités pédagogiques et aisance relationnelle
- Organisation, capacité à planifier et prioriser les activités
- Initiative et autonomie dans la réalisation des missions
- Volonté de développer ou acquérir des compétences techniques
- Curiosité scientifique et intérêt pour les projets de recherche du laboratoire.

Contexte de travail

L'ingénieur d'étude en techniques biologiques (H/F) sera affecté au laboratoire Bioénergétique et
Ingénierie des Protéines, qui regroupe 46 statutaires (chercheurs, enseignants-chercheurs,
ingénieurs) et 42 non-statutaires (doctorants, postdoctorants et ingénieurs), situé à Marseille sur
le campus Joseph Aiguier. L'Unité est reconnue pour sa pluridisciplinarité et son expertise dans
l'étude des métabolismes microbiens. Elle constitue l'une des quatre unités de l'Institut de
Microbiologie de la Méditerranée, une fédération de recherche rassemblant plus de 300 personnes,
disposant d'un large éventail de plateformes scientifiques, offrant à ses membres des équipements
technologiques et des expertises techniques de haut niveau (protéomique, transcriptomique,
microscopie...).
La personne recrutée sera rattachée à l'équipe de recherche « Systèmes d'adaptation des bactéries »,
composée de 9 agents statutaires (5 chercheurs, 3 enseignants-chercheurs, 1 ITA), 5 doctorants, 1
postdoctorant et 1 ingénieur CDD. Il/Elle sera placé sous la responsabilité hiérarchique des
responsables d'équipe, Marianne Ilbert et Olivier Genest.
Les travaux de l'équipe visent à caractériser les voies de régulation et les réponses cellulaires
impliquées dans les mécanismes d'adaptation des bactéries à leur environnement, en abordant
plusieurs échelles, de la molécule à la communauté bactérienne, à travers divers thématiques :
protéines chaperons et protéostasie, communication et transduction du signal au sein de communautés
bactériennes, mécanismes mis en œuvre lors de stress métalliques, reprogrammation métabolique en
réponse au stress.
La personne recrutée jouera un rôle clé dans le développement de certains de ces projets et
contribuera activement au bon fonctionnement de l'équipe de recherche ainsi qu'à des missions
collectives du laboratoire.